Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sh2d5Q8JZW5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sh2d5Q8JZW5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sh2d5Q8JZW5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sh2d5Q8JZW5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sh2d5Q8JZW5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sh2d5Q8JZW5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Sh2d5Q8JZW5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sh2d5Q8JZW5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sh2d5Q8JZW5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sh2d5Q8JZW5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sh2d5Q8JZW5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sh2d5Q8JZW5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sh2d5Q8JZW5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sh2d5Q8JZW5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sh2d5Q8JZW5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sh2d5Q8JZW5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sh2d5Q8JZW5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sh2d5Q8JZW5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sh2d5Q8JZW5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sh2d5Q8JZW5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sh2d5Q8JZW5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sh2d5Q8JZW5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Sh2d5Q8JZW5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sh2d5Q8JZW5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sh2d5Q8JZW5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sh2d5Q8JZW5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sh2d5Q8JZW5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sh2d5Q8JZW5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sh2d5Q8JZW5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sh2d5Q8JZW5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sh2d5Q8JZW5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sh2d5Q8JZW5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Sh2d5Q8JZW5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Sh2d5Q8JZW5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sh2d5Q8JZW5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sh2d5Q8JZW5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sh2d5Q8JZW5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sh2d5Q8JZW5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sh2d5Q8JZW5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sh2d5Q8JZW5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sh2d5Q8JZW5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sh2d5Q8JZW5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sh2d5Q8JZW5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sh2d5Q8JZW5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sh2d5Q8JZW5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sh2d5Q8JZW5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sh2d5Q8JZW5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sh2d5Q8JZW5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sh2d5Q8JZW5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sh2d5Q8JZW5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Sh2d5Q8JZW5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sh2d5Q8JZW5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sh2d5Q8JZW5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sh2d5Q8JZW5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sh2d5Q8JZW5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sh2d5Q8JZW5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Sh2d5Q8JZW5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sh2d5Q8JZW5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sh2d5Q8JZW5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sh2d5Q8JZW5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sh2d5Q8JZW5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sh2d5Q8JZW5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sh2d5Q8JZW5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sh2d5Q8JZW5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Sh2d5Q8JZW5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sh2d5Q8JZW5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sh2d5Q8JZW5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sh2d5Q8JZW5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sh2d5Q8JZW5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sh2d5Q8JZW5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sh2d5Q8JZW5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sh2d5Q8JZW5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sh2d5Q8JZW5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sh2d5Q8JZW5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Sh2d5Q8JZW5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sh2d5Q8JZW5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sh2d5Q8JZW5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sh2d5Q8JZW5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sh2d5Q8JZW5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sh2d5Q8JZW5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sh2d5Q8JZW5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sh2d5Q8JZW5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Sh2d5Q8JZW5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Sh2d5Q8JZW5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sh2d5Q8JZW5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sh2d5Q8JZW5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sh2d5Q8JZW5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sh2d5Q8JZW5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sh2d5Q8JZW5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sh2d5Q8JZW5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sh2d5Q8JZW5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sh2d5Q8JZW5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sh2d5Q8JZW5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Sh2d5Q8JZW5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sh2d5Q8JZW5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sh2d5Q8JZW5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Sh2d5Q8JZW5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sh2d5Q8JZW5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sh2d5Q8JZW5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms