Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHS2

Dnajc22, DnaJ homolog subfamily C member 22, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc22Q8CHS2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dnajc22Q8CHS2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnajc22Q8CHS2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnajc22Q8CHS2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dnajc22Q8CHS2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnajc22Q8CHS2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Dnajc22Q8CHS2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Dnajc22Q8CHS2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnajc22Q8CHS2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dnajc22Q8CHS2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dnajc22Q8CHS2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dnajc22Q8CHS2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dnajc22Q8CHS2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dnajc22Q8CHS2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnajc22Q8CHS2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dnajc22Q8CHS2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dnajc22Q8CHS2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dnajc22Q8CHS2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dnajc22Q8CHS2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dnajc22Q8CHS2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dnajc22Q8CHS2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dnajc22Q8CHS2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dnajc22Q8CHS2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dnajc22Q8CHS2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Dnajc22Q8CHS2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Dnajc22Q8CHS2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dnajc22Q8CHS2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dnajc22Q8CHS2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dnajc22Q8CHS2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dnajc22Q8CHS2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dnajc22Q8CHS2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dnajc22Q8CHS2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnajc22Q8CHS2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnajc22Q8CHS2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnajc22Q8CHS2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dnajc22Q8CHS2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dnajc22Q8CHS2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dnajc22Q8CHS2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dnajc22Q8CHS2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dnajc22Q8CHS2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dnajc22Q8CHS2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dnajc22Q8CHS2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Dnajc22Q8CHS2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Dnajc22Q8CHS2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dnajc22Q8CHS2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dnajc22Q8CHS2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dnajc22Q8CHS2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dnajc22Q8CHS2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dnajc22Q8CHS2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dnajc22Q8CHS2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dnajc22Q8CHS2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dnajc22Q8CHS2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dnajc22Q8CHS2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dnajc22Q8CHS2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dnajc22Q8CHS2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dnajc22Q8CHS2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnajc22Q8CHS2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnajc22Q8CHS2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnajc22Q8CHS2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dnajc22Q8CHS2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnajc22Q8CHS2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dnajc22Q8CHS2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dnajc22Q8CHS2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dnajc22Q8CHS2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dnajc22Q8CHS2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dnajc22Q8CHS2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dnajc22Q8CHS2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Dnajc22Q8CHS2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnajc22Q8CHS2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnajc22Q8CHS2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnajc22Q8CHS2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dnajc22Q8CHS2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnajc22Q8CHS2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dnajc22Q8CHS2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dnajc22Q8CHS2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dnajc22Q8CHS2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dnajc22Q8CHS2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dnajc22Q8CHS2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dnajc22Q8CHS2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dnajc22Q8CHS2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dnajc22Q8CHS2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Dnajc22Q8CHS2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dnajc22Q8CHS2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dnajc22Q8CHS2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Dnajc22Q8CHS2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dnajc22Q8CHS2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dnajc22Q8CHS2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dnajc22Q8CHS2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dnajc22Q8CHS2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dnajc22Q8CHS2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dnajc22Q8CHS2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dnajc22Q8CHS2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dnajc22Q8CHS2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dnajc22Q8CHS2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dnajc22Q8CHS2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dnajc22Q8CHS2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Dnajc22Q8CHS2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnajc22Q8CHS2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnajc22Q8CHS2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnajc22Q8CHS2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms