Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rdh13Q8CEE7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rdh13Q8CEE7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rdh13Q8CEE7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rdh13Q8CEE7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rdh13Q8CEE7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rdh13Q8CEE7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rdh13Q8CEE7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rdh13Q8CEE7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rdh13Q8CEE7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rdh13Q8CEE7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rdh13Q8CEE7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rdh13Q8CEE7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rdh13Q8CEE7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rdh13Q8CEE7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rdh13Q8CEE7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Rdh13Q8CEE7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rdh13Q8CEE7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rdh13Q8CEE7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rdh13Q8CEE7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rdh13Q8CEE7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rdh13Q8CEE7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rdh13Q8CEE7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rdh13Q8CEE7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rdh13Q8CEE7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rdh13Q8CEE7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rdh13Q8CEE7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rdh13Q8CEE7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rdh13Q8CEE7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Rdh13Q8CEE7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Rdh13Q8CEE7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rdh13Q8CEE7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Rdh13Q8CEE7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rdh13Q8CEE7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rdh13Q8CEE7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rdh13Q8CEE7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rdh13Q8CEE7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rdh13Q8CEE7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Rdh13Q8CEE7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rdh13Q8CEE7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rdh13Q8CEE7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rdh13Q8CEE7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rdh13Q8CEE7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rdh13Q8CEE7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rdh13Q8CEE7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rdh13Q8CEE7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rdh13Q8CEE7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rdh13Q8CEE7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rdh13Q8CEE7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rdh13Q8CEE7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rdh13Q8CEE7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rdh13Q8CEE7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rdh13Q8CEE7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rdh13Q8CEE7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rdh13Q8CEE7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rdh13Q8CEE7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rdh13Q8CEE7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rdh13Q8CEE7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rdh13Q8CEE7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rdh13Q8CEE7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rdh13Q8CEE7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rdh13Q8CEE7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rdh13Q8CEE7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rdh13Q8CEE7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Rdh13Q8CEE7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rdh13Q8CEE7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rdh13Q8CEE7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rdh13Q8CEE7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rdh13Q8CEE7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rdh13Q8CEE7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rdh13Q8CEE7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rdh13Q8CEE7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rdh13Q8CEE7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rdh13Q8CEE7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rdh13Q8CEE7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rdh13Q8CEE7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Rdh13Q8CEE7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rdh13Q8CEE7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rdh13Q8CEE7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rdh13Q8CEE7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rdh13Q8CEE7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rdh13Q8CEE7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rdh13Q8CEE7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rdh13Q8CEE7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Rdh13Q8CEE7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rdh13Q8CEE7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rdh13Q8CEE7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rdh13Q8CEE7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rdh13Q8CEE7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Rdh13Q8CEE7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rdh13Q8CEE7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Rdh13Q8CEE7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rdh13Q8CEE7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rdh13Q8CEE7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rdh13Q8CEE7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rdh13Q8CEE7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rdh13Q8CEE7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rdh13Q8CEE7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Rdh13Q8CEE7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rdh13Q8CEE7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
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