Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD94

Lin52, Protein lin-52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin52Q8CD94 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Lin52Q8CD94 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Lin52Q8CD94 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26,16■■□□□ 1,78
Lin52Q8CD94 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,77
Lin52Q8CD94 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26,13■■□□□ 1,77
Lin52Q8CD94 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,07■■□□□ 1,76
Lin52Q8CD94 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Lin52Q8CD94 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26,06■■□□□ 1,76
Lin52Q8CD94 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Lin52Q8CD94 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26,04■■□□□ 1,76
Lin52Q8CD94 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26,01■■□□□ 1,76
Lin52Q8CD94 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1,75
Lin52Q8CD94 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Lin52Q8CD94 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Lin52Q8CD94 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,94■■□□□ 1,74
Lin52Q8CD94 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25,94■■□□□ 1,74
Lin52Q8CD94 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Lin52Q8CD94 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Lin52Q8CD94 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Lin52Q8CD94 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25,89■■□□□ 1,74
Lin52Q8CD94 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Lin52Q8CD94 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Lin52Q8CD94 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25,85■■□□□ 1,73
Lin52Q8CD94 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Lin52Q8CD94 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Lin52Q8CD94 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Lin52Q8CD94 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Lin52Q8CD94 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Lin52Q8CD94 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Lin52Q8CD94 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Lin52Q8CD94 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Lin52Q8CD94 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,71
Lin52Q8CD94 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Lin52Q8CD94 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Lin52Q8CD94 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Lin52Q8CD94 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Lin52Q8CD94 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,67■■□□□ 1,7
Lin52Q8CD94 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Lin52Q8CD94 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Lin52Q8CD94 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25,6■■□□□ 1,69
Lin52Q8CD94 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Lin52Q8CD94 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Lin52Q8CD94 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25,51■■□□□ 1,67
Lin52Q8CD94 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25,5■■□□□ 1,67
Lin52Q8CD94 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Lin52Q8CD94 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Lin52Q8CD94 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Lin52Q8CD94 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,44■■□□□ 1,66
Lin52Q8CD94 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Lin52Q8CD94 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Lin52Q8CD94 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Lin52Q8CD94 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Lin52Q8CD94 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25,33■■□□□ 1,65
Lin52Q8CD94 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Lin52Q8CD94 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Lin52Q8CD94 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Lin52Q8CD94 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Lin52Q8CD94 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Lin52Q8CD94 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25,29■■□□□ 1,64
Lin52Q8CD94 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Lin52Q8CD94 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Lin52Q8CD94 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25,24■■□□□ 1,63
Lin52Q8CD94 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Lin52Q8CD94 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Lin52Q8CD94 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Lin52Q8CD94 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Lin52Q8CD94 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Lin52Q8CD94 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Lin52Q8CD94 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Lin52Q8CD94 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,61
Lin52Q8CD94 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Lin52Q8CD94 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25,13■■□□□ 1,61
Lin52Q8CD94 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Lin52Q8CD94 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Lin52Q8CD94 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Lin52Q8CD94 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Lin52Q8CD94 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Lin52Q8CD94 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,1■■□□□ 1,61
Lin52Q8CD94 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25,09■■□□□ 1,61
Lin52Q8CD94 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Lin52Q8CD94 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Lin52Q8CD94 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Lin52Q8CD94 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Lin52Q8CD94 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25,05■■□□□ 1,6
Lin52Q8CD94 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Lin52Q8CD94 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Lin52Q8CD94 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Lin52Q8CD94 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1,59
Lin52Q8CD94 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24,99■■□□□ 1,59
Lin52Q8CD94 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24,99■■□□□ 1,59
Lin52Q8CD94 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24,99■■□□□ 1,59
Lin52Q8CD94 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Lin52Q8CD94 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Lin52Q8CD94 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24,95■■□□□ 1,58
Lin52Q8CD94 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24,94■■□□□ 1,58
Lin52Q8CD94 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Lin52Q8CD94 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Lin52Q8CD94 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Lin52Q8CD94 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Lin52Q8CD94 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
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