Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD94

Lin52, Protein lin-52 homolog, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin52Q8CD94 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lin52Q8CD94 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lin52Q8CD94 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lin52Q8CD94 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lin52Q8CD94 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Lin52Q8CD94 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lin52Q8CD94 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lin52Q8CD94 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Lin52Q8CD94 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lin52Q8CD94 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lin52Q8CD94 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.01■■□□□ 1.76
Lin52Q8CD94 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Lin52Q8CD94 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lin52Q8CD94 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lin52Q8CD94 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lin52Q8CD94 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lin52Q8CD94 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lin52Q8CD94 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lin52Q8CD94 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lin52Q8CD94 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lin52Q8CD94 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lin52Q8CD94 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lin52Q8CD94 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Lin52Q8CD94 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lin52Q8CD94 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lin52Q8CD94 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lin52Q8CD94 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lin52Q8CD94 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lin52Q8CD94 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lin52Q8CD94 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lin52Q8CD94 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lin52Q8CD94 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Lin52Q8CD94 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lin52Q8CD94 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lin52Q8CD94 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lin52Q8CD94 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lin52Q8CD94 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lin52Q8CD94 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lin52Q8CD94 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lin52Q8CD94 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lin52Q8CD94 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lin52Q8CD94 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lin52Q8CD94 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lin52Q8CD94 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lin52Q8CD94 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lin52Q8CD94 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lin52Q8CD94 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lin52Q8CD94 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lin52Q8CD94 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lin52Q8CD94 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lin52Q8CD94 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lin52Q8CD94 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lin52Q8CD94 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lin52Q8CD94 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lin52Q8CD94 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lin52Q8CD94 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lin52Q8CD94 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lin52Q8CD94 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lin52Q8CD94 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Lin52Q8CD94 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lin52Q8CD94 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lin52Q8CD94 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Lin52Q8CD94 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lin52Q8CD94 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lin52Q8CD94 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lin52Q8CD94 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lin52Q8CD94 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lin52Q8CD94 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lin52Q8CD94 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lin52Q8CD94 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lin52Q8CD94 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lin52Q8CD94 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Lin52Q8CD94 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lin52Q8CD94 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lin52Q8CD94 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lin52Q8CD94 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lin52Q8CD94 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lin52Q8CD94 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lin52Q8CD94 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Lin52Q8CD94 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lin52Q8CD94 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lin52Q8CD94 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lin52Q8CD94 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lin52Q8CD94 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Lin52Q8CD94 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lin52Q8CD94 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lin52Q8CD94 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lin52Q8CD94 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Lin52Q8CD94 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lin52Q8CD94 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lin52Q8CD94 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lin52Q8CD94 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lin52Q8CD94 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lin52Q8CD94 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Lin52Q8CD94 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Lin52Q8CD94 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lin52Q8CD94 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lin52Q8CD94 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lin52Q8CD94 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lin52Q8CD94 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
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