Protein–RNA interactions for Protein: Q8C262

Irgc, Interferon-inducible GTPase 5, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IrgcQ8C262 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IrgcQ8C262 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IrgcQ8C262 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IrgcQ8C262 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IrgcQ8C262 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IrgcQ8C262 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IrgcQ8C262 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IrgcQ8C262 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IrgcQ8C262 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IrgcQ8C262 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IrgcQ8C262 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IrgcQ8C262 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IrgcQ8C262 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IrgcQ8C262 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IrgcQ8C262 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IrgcQ8C262 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IrgcQ8C262 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IrgcQ8C262 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IrgcQ8C262 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IrgcQ8C262 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IrgcQ8C262 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IrgcQ8C262 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
IrgcQ8C262 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IrgcQ8C262 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IrgcQ8C262 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IrgcQ8C262 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IrgcQ8C262 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IrgcQ8C262 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IrgcQ8C262 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IrgcQ8C262 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IrgcQ8C262 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IrgcQ8C262 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IrgcQ8C262 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IrgcQ8C262 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IrgcQ8C262 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IrgcQ8C262 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IrgcQ8C262 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IrgcQ8C262 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IrgcQ8C262 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IrgcQ8C262 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IrgcQ8C262 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IrgcQ8C262 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IrgcQ8C262 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
IrgcQ8C262 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IrgcQ8C262 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IrgcQ8C262 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IrgcQ8C262 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IrgcQ8C262 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IrgcQ8C262 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IrgcQ8C262 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
IrgcQ8C262 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IrgcQ8C262 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IrgcQ8C262 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IrgcQ8C262 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IrgcQ8C262 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IrgcQ8C262 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IrgcQ8C262 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IrgcQ8C262 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IrgcQ8C262 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IrgcQ8C262 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IrgcQ8C262 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IrgcQ8C262 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IrgcQ8C262 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IrgcQ8C262 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IrgcQ8C262 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IrgcQ8C262 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IrgcQ8C262 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IrgcQ8C262 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IrgcQ8C262 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IrgcQ8C262 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IrgcQ8C262 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
IrgcQ8C262 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IrgcQ8C262 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IrgcQ8C262 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IrgcQ8C262 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IrgcQ8C262 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IrgcQ8C262 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IrgcQ8C262 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IrgcQ8C262 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IrgcQ8C262 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IrgcQ8C262 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IrgcQ8C262 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IrgcQ8C262 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IrgcQ8C262 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IrgcQ8C262 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IrgcQ8C262 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IrgcQ8C262 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IrgcQ8C262 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IrgcQ8C262 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
IrgcQ8C262 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IrgcQ8C262 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IrgcQ8C262 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23■■□□□ 1.27
IrgcQ8C262 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IrgcQ8C262 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IrgcQ8C262 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IrgcQ8C262 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IrgcQ8C262 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IrgcQ8C262 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IrgcQ8C262 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IrgcQ8C262 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms