Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Trerf1Q8BXJ2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Trerf1Q8BXJ2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Trerf1Q8BXJ2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Trerf1Q8BXJ2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,4■■■□□ 2,14
Trerf1Q8BXJ2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28,39■■■□□ 2,14
Trerf1Q8BXJ2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Trerf1Q8BXJ2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Trerf1Q8BXJ2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28,34■■■□□ 2,13
Trerf1Q8BXJ2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Trerf1Q8BXJ2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Trerf1Q8BXJ2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28,3■■■□□ 2,12
Trerf1Q8BXJ2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,3■■■□□ 2,12
Trerf1Q8BXJ2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Trerf1Q8BXJ2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Trerf1Q8BXJ2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Trerf1Q8BXJ2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Trerf1Q8BXJ2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,19■■■□□ 2,1
Trerf1Q8BXJ2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Trerf1Q8BXJ2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Trerf1Q8BXJ2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,15■■■□□ 2,1
Trerf1Q8BXJ2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28,15■■■□□ 2,1
Trerf1Q8BXJ2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Trerf1Q8BXJ2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Trerf1Q8BXJ2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Trerf1Q8BXJ2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,11■■■□□ 2,09
Trerf1Q8BXJ2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Trerf1Q8BXJ2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Trerf1Q8BXJ2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Trerf1Q8BXJ2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Trerf1Q8BXJ2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27,96■■■□□ 2,07
Trerf1Q8BXJ2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27,96■■■□□ 2,07
Trerf1Q8BXJ2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Trerf1Q8BXJ2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Trerf1Q8BXJ2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Trerf1Q8BXJ2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27,88■■■□□ 2,05
Trerf1Q8BXJ2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,88■■■□□ 2,05
Trerf1Q8BXJ2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Trerf1Q8BXJ2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Trerf1Q8BXJ2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Trerf1Q8BXJ2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Trerf1Q8BXJ2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Trerf1Q8BXJ2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27,82■■■□□ 2,04
Trerf1Q8BXJ2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Trerf1Q8BXJ2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Trerf1Q8BXJ2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27,71■■■□□ 2,03
Trerf1Q8BXJ2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27,71■■■□□ 2,03
Trerf1Q8BXJ2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Trerf1Q8BXJ2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27,7■■■□□ 2,03
Trerf1Q8BXJ2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27,69■■■□□ 2,02
Trerf1Q8BXJ2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Trerf1Q8BXJ2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Trerf1Q8BXJ2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Trerf1Q8BXJ2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Trerf1Q8BXJ2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Trerf1Q8BXJ2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Trerf1Q8BXJ2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Trerf1Q8BXJ2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Trerf1Q8BXJ2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Trerf1Q8BXJ2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27,53■■■□□ 2
Trerf1Q8BXJ2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,5■■□□□ 1,99
Trerf1Q8BXJ2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Trerf1Q8BXJ2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Trerf1Q8BXJ2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27,48■■□□□ 1,99
Trerf1Q8BXJ2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,48■■□□□ 1,99
Trerf1Q8BXJ2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Trerf1Q8BXJ2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27,46■■□□□ 1,99
Trerf1Q8BXJ2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,45■■□□□ 1,98
Trerf1Q8BXJ2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Trerf1Q8BXJ2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Trerf1Q8BXJ2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Trerf1Q8BXJ2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27,41■■□□□ 1,98
Trerf1Q8BXJ2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Trerf1Q8BXJ2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Trerf1Q8BXJ2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Trerf1Q8BXJ2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27,34■■□□□ 1,97
Trerf1Q8BXJ2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Trerf1Q8BXJ2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Trerf1Q8BXJ2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Trerf1Q8BXJ2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27,25■■□□□ 1,95
Trerf1Q8BXJ2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Trerf1Q8BXJ2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Trerf1Q8BXJ2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Trerf1Q8BXJ2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Trerf1Q8BXJ2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,2■■□□□ 1,94
Trerf1Q8BXJ2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Trerf1Q8BXJ2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27,17■■□□□ 1,94
Trerf1Q8BXJ2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Trerf1Q8BXJ2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Trerf1Q8BXJ2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Trerf1Q8BXJ2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27,14■■□□□ 1,94
Trerf1Q8BXJ2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27,14■■□□□ 1,94
Trerf1Q8BXJ2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Trerf1Q8BXJ2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27,12■■□□□ 1,93
Trerf1Q8BXJ2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27,12■■□□□ 1,93
Trerf1Q8BXJ2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Trerf1Q8BXJ2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27,1■■□□□ 1,93
Trerf1Q8BXJ2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Trerf1Q8BXJ2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27,08■■□□□ 1,93
Trerf1Q8BXJ2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
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