Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Rbbp5Q8BX09 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Rbbp5Q8BX09 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Rbbp5Q8BX09 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27,79■■■□□ 2,04
Rbbp5Q8BX09 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,78■■■□□ 2,04
Rbbp5Q8BX09 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Rbbp5Q8BX09 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Rbbp5Q8BX09 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Rbbp5Q8BX09 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Rbbp5Q8BX09 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Rbbp5Q8BX09 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,03
Rbbp5Q8BX09 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Rbbp5Q8BX09 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Rbbp5Q8BX09 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27,65■■■□□ 2,02
Rbbp5Q8BX09 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Rbbp5Q8BX09 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Rbbp5Q8BX09 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,64■■■□□ 2,02
Rbbp5Q8BX09 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Rbbp5Q8BX09 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,61■■■□□ 2,01
Rbbp5Q8BX09 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27,61■■■□□ 2,01
Rbbp5Q8BX09 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Rbbp5Q8BX09 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,58■■■□□ 2,01
Rbbp5Q8BX09 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Rbbp5Q8BX09 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27,57■■■□□ 2
Rbbp5Q8BX09 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,52■■■□□ 2
Rbbp5Q8BX09 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Rbbp5Q8BX09 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27,47■■□□□ 1,99
Rbbp5Q8BX09 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,46■■□□□ 1,99
Rbbp5Q8BX09 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,99
Rbbp5Q8BX09 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Rbbp5Q8BX09 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Rbbp5Q8BX09 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27,42■■□□□ 1,98
Rbbp5Q8BX09 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Rbbp5Q8BX09 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,35■■□□□ 1,97
Rbbp5Q8BX09 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Rbbp5Q8BX09 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Rbbp5Q8BX09 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Rbbp5Q8BX09 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Rbbp5Q8BX09 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Rbbp5Q8BX09 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Rbbp5Q8BX09 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Rbbp5Q8BX09 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Rbbp5Q8BX09 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27,2■■□□□ 1,94
Rbbp5Q8BX09 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Rbbp5Q8BX09 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Rbbp5Q8BX09 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27,14■■□□□ 1,94
Rbbp5Q8BX09 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Rbbp5Q8BX09 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Rbbp5Q8BX09 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27,1■■□□□ 1,93
Rbbp5Q8BX09 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Rbbp5Q8BX09 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Rbbp5Q8BX09 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Rbbp5Q8BX09 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27,03■■□□□ 1,92
Rbbp5Q8BX09 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27,02■■□□□ 1,92
Rbbp5Q8BX09 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Rbbp5Q8BX09 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27,01■■□□□ 1,91
Rbbp5Q8BX09 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27■■□□□ 1,91
Rbbp5Q8BX09 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Rbbp5Q8BX09 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Rbbp5Q8BX09 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Rbbp5Q8BX09 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,97■■□□□ 1,91
Rbbp5Q8BX09 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Rbbp5Q8BX09 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26,95■■□□□ 1,9
Rbbp5Q8BX09 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26,94■■□□□ 1,9
Rbbp5Q8BX09 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,91■■□□□ 1,9
Rbbp5Q8BX09 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Rbbp5Q8BX09 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26,89■■□□□ 1,9
Rbbp5Q8BX09 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,89
Rbbp5Q8BX09 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Rbbp5Q8BX09 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26,85■■□□□ 1,89
Rbbp5Q8BX09 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26,83■■□□□ 1,89
Rbbp5Q8BX09 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,88
Rbbp5Q8BX09 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,88
Rbbp5Q8BX09 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Rbbp5Q8BX09 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Rbbp5Q8BX09 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26,81■■□□□ 1,88
Rbbp5Q8BX09 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Rbbp5Q8BX09 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Rbbp5Q8BX09 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Rbbp5Q8BX09 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26,76■■□□□ 1,87
Rbbp5Q8BX09 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Rbbp5Q8BX09 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Rbbp5Q8BX09 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Rbbp5Q8BX09 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Rbbp5Q8BX09 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Rbbp5Q8BX09 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26,57■■□□□ 1,84
Rbbp5Q8BX09 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26,57■■□□□ 1,84
Rbbp5Q8BX09 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Rbbp5Q8BX09 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Rbbp5Q8BX09 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26,56■■□□□ 1,84
Rbbp5Q8BX09 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Rbbp5Q8BX09 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Rbbp5Q8BX09 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Rbbp5Q8BX09 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Rbbp5Q8BX09 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,52■■□□□ 1,84
Rbbp5Q8BX09 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Rbbp5Q8BX09 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Rbbp5Q8BX09 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,5■■□□□ 1,83
Rbbp5Q8BX09 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Rbbp5Q8BX09 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26,45■■□□□ 1,83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,4 ms