Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tmco3Q8BH01 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tmco3Q8BH01 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tmco3Q8BH01 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tmco3Q8BH01 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Tmco3Q8BH01 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Tmco3Q8BH01 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Tmco3Q8BH01 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Tmco3Q8BH01 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tmco3Q8BH01 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tmco3Q8BH01 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Tmco3Q8BH01 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Tmco3Q8BH01 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Tmco3Q8BH01 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Tmco3Q8BH01 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tmco3Q8BH01 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Tmco3Q8BH01 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Tmco3Q8BH01 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tmco3Q8BH01 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Tmco3Q8BH01 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Tmco3Q8BH01 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tmco3Q8BH01 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tmco3Q8BH01 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Tmco3Q8BH01 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tmco3Q8BH01 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tmco3Q8BH01 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tmco3Q8BH01 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Tmco3Q8BH01 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Tmco3Q8BH01 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Tmco3Q8BH01 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Tmco3Q8BH01 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Tmco3Q8BH01 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tmco3Q8BH01 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tmco3Q8BH01 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tmco3Q8BH01 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tmco3Q8BH01 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tmco3Q8BH01 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tmco3Q8BH01 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tmco3Q8BH01 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tmco3Q8BH01 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tmco3Q8BH01 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tmco3Q8BH01 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tmco3Q8BH01 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tmco3Q8BH01 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tmco3Q8BH01 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tmco3Q8BH01 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tmco3Q8BH01 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tmco3Q8BH01 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tmco3Q8BH01 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tmco3Q8BH01 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tmco3Q8BH01 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tmco3Q8BH01 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tmco3Q8BH01 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tmco3Q8BH01 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tmco3Q8BH01 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tmco3Q8BH01 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Tmco3Q8BH01 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tmco3Q8BH01 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tmco3Q8BH01 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Tmco3Q8BH01 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tmco3Q8BH01 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tmco3Q8BH01 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tmco3Q8BH01 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tmco3Q8BH01 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tmco3Q8BH01 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tmco3Q8BH01 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tmco3Q8BH01 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tmco3Q8BH01 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tmco3Q8BH01 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tmco3Q8BH01 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Tmco3Q8BH01 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tmco3Q8BH01 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tmco3Q8BH01 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tmco3Q8BH01 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tmco3Q8BH01 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tmco3Q8BH01 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Tmco3Q8BH01 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tmco3Q8BH01 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tmco3Q8BH01 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tmco3Q8BH01 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Tmco3Q8BH01 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tmco3Q8BH01 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tmco3Q8BH01 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tmco3Q8BH01 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tmco3Q8BH01 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tmco3Q8BH01 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Tmco3Q8BH01 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tmco3Q8BH01 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tmco3Q8BH01 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tmco3Q8BH01 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Tmco3Q8BH01 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tmco3Q8BH01 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Tmco3Q8BH01 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tmco3Q8BH01 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tmco3Q8BH01 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tmco3Q8BH01 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tmco3Q8BH01 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tmco3Q8BH01 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tmco3Q8BH01 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tmco3Q8BH01 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms