Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y56

Rbsn, Rabenosyn-5, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RbsnQ80Y56 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RbsnQ80Y56 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RbsnQ80Y56 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RbsnQ80Y56 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RbsnQ80Y56 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RbsnQ80Y56 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RbsnQ80Y56 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RbsnQ80Y56 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
RbsnQ80Y56 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RbsnQ80Y56 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RbsnQ80Y56 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RbsnQ80Y56 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RbsnQ80Y56 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RbsnQ80Y56 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RbsnQ80Y56 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RbsnQ80Y56 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RbsnQ80Y56 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RbsnQ80Y56 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RbsnQ80Y56 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RbsnQ80Y56 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RbsnQ80Y56 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RbsnQ80Y56 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RbsnQ80Y56 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RbsnQ80Y56 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RbsnQ80Y56 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RbsnQ80Y56 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RbsnQ80Y56 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RbsnQ80Y56 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RbsnQ80Y56 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RbsnQ80Y56 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RbsnQ80Y56 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RbsnQ80Y56 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RbsnQ80Y56 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RbsnQ80Y56 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RbsnQ80Y56 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RbsnQ80Y56 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RbsnQ80Y56 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RbsnQ80Y56 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RbsnQ80Y56 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RbsnQ80Y56 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RbsnQ80Y56 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RbsnQ80Y56 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RbsnQ80Y56 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RbsnQ80Y56 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RbsnQ80Y56 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RbsnQ80Y56 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RbsnQ80Y56 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RbsnQ80Y56 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RbsnQ80Y56 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RbsnQ80Y56 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RbsnQ80Y56 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RbsnQ80Y56 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RbsnQ80Y56 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RbsnQ80Y56 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RbsnQ80Y56 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RbsnQ80Y56 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RbsnQ80Y56 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RbsnQ80Y56 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RbsnQ80Y56 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RbsnQ80Y56 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RbsnQ80Y56 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RbsnQ80Y56 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RbsnQ80Y56 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RbsnQ80Y56 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RbsnQ80Y56 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RbsnQ80Y56 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RbsnQ80Y56 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RbsnQ80Y56 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RbsnQ80Y56 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RbsnQ80Y56 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RbsnQ80Y56 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RbsnQ80Y56 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RbsnQ80Y56 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RbsnQ80Y56 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RbsnQ80Y56 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RbsnQ80Y56 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RbsnQ80Y56 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RbsnQ80Y56 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RbsnQ80Y56 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RbsnQ80Y56 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RbsnQ80Y56 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RbsnQ80Y56 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RbsnQ80Y56 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RbsnQ80Y56 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RbsnQ80Y56 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RbsnQ80Y56 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RbsnQ80Y56 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RbsnQ80Y56 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RbsnQ80Y56 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RbsnQ80Y56 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RbsnQ80Y56 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RbsnQ80Y56 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RbsnQ80Y56 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RbsnQ80Y56 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RbsnQ80Y56 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RbsnQ80Y56 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RbsnQ80Y56 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RbsnQ80Y56 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RbsnQ80Y56 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RbsnQ80Y56 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms