Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y56

Rbsn, Rabenosyn-5, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RbsnQ80Y56 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
RbsnQ80Y56 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
RbsnQ80Y56 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
RbsnQ80Y56 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
RbsnQ80Y56 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
RbsnQ80Y56 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
RbsnQ80Y56 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
RbsnQ80Y56 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28,64■■■□□ 2,18
RbsnQ80Y56 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,63■■■□□ 2,17
RbsnQ80Y56 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
RbsnQ80Y56 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
RbsnQ80Y56 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28,57■■■□□ 2,16
RbsnQ80Y56 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28,52■■■□□ 2,16
RbsnQ80Y56 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
RbsnQ80Y56 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
RbsnQ80Y56 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
RbsnQ80Y56 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,46■■■□□ 2,15
RbsnQ80Y56 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
RbsnQ80Y56 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
RbsnQ80Y56 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28,39■■■□□ 2,14
RbsnQ80Y56 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
RbsnQ80Y56 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
RbsnQ80Y56 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28,28■■■□□ 2,12
RbsnQ80Y56 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
RbsnQ80Y56 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
RbsnQ80Y56 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
RbsnQ80Y56 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,17■■■□□ 2,1
RbsnQ80Y56 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
RbsnQ80Y56 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
RbsnQ80Y56 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
RbsnQ80Y56 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
RbsnQ80Y56 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
RbsnQ80Y56 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
RbsnQ80Y56 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28,07■■■□□ 2,08
RbsnQ80Y56 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
RbsnQ80Y56 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
RbsnQ80Y56 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
RbsnQ80Y56 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28,02■■■□□ 2,08
RbsnQ80Y56 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,08
RbsnQ80Y56 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
RbsnQ80Y56 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,07
RbsnQ80Y56 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,92■■■□□ 2,06
RbsnQ80Y56 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
RbsnQ80Y56 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
RbsnQ80Y56 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27,9■■■□□ 2,06
RbsnQ80Y56 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27,89■■■□□ 2,06
RbsnQ80Y56 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,89■■■□□ 2,06
RbsnQ80Y56 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
RbsnQ80Y56 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
RbsnQ80Y56 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
RbsnQ80Y56 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
RbsnQ80Y56 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
RbsnQ80Y56 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
RbsnQ80Y56 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27,83■■■□□ 2,05
RbsnQ80Y56 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,82■■■□□ 2,04
RbsnQ80Y56 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
RbsnQ80Y56 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
RbsnQ80Y56 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27,78■■■□□ 2,04
RbsnQ80Y56 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27,75■■■□□ 2,03
RbsnQ80Y56 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
RbsnQ80Y56 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
RbsnQ80Y56 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
RbsnQ80Y56 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27,67■■■□□ 2,02
RbsnQ80Y56 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
RbsnQ80Y56 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27,66■■■□□ 2,02
RbsnQ80Y56 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
RbsnQ80Y56 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
RbsnQ80Y56 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,01
RbsnQ80Y56 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
RbsnQ80Y56 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
RbsnQ80Y56 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
RbsnQ80Y56 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
RbsnQ80Y56 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
RbsnQ80Y56 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
RbsnQ80Y56 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,58■■■□□ 2,01
RbsnQ80Y56 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
RbsnQ80Y56 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,56■■■□□ 2
RbsnQ80Y56 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
RbsnQ80Y56 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
RbsnQ80Y56 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
RbsnQ80Y56 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27,5■■□□□ 1,99
RbsnQ80Y56 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27,5■■□□□ 1,99
RbsnQ80Y56 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
RbsnQ80Y56 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27,49■■□□□ 1,99
RbsnQ80Y56 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27,47■■□□□ 1,99
RbsnQ80Y56 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
RbsnQ80Y56 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,45■■□□□ 1,99
RbsnQ80Y56 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,45■■□□□ 1,98
RbsnQ80Y56 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
RbsnQ80Y56 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
RbsnQ80Y56 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27,41■■□□□ 1,98
RbsnQ80Y56 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
RbsnQ80Y56 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27,38■■□□□ 1,97
RbsnQ80Y56 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
RbsnQ80Y56 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
RbsnQ80Y56 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
RbsnQ80Y56 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
RbsnQ80Y56 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,33■■□□□ 1,97
RbsnQ80Y56 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
RbsnQ80Y56 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21,7 ms