Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ctdp1Q7TSG2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ctdp1Q7TSG2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ctdp1Q7TSG2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ctdp1Q7TSG2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ctdp1Q7TSG2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ctdp1Q7TSG2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ctdp1Q7TSG2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ctdp1Q7TSG2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Ctdp1Q7TSG2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ctdp1Q7TSG2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ctdp1Q7TSG2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ctdp1Q7TSG2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ctdp1Q7TSG2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ctdp1Q7TSG2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ctdp1Q7TSG2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ctdp1Q7TSG2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ctdp1Q7TSG2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ctdp1Q7TSG2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ctdp1Q7TSG2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ctdp1Q7TSG2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ctdp1Q7TSG2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ctdp1Q7TSG2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ctdp1Q7TSG2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ctdp1Q7TSG2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ctdp1Q7TSG2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ctdp1Q7TSG2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ctdp1Q7TSG2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Ctdp1Q7TSG2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ctdp1Q7TSG2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Ctdp1Q7TSG2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ctdp1Q7TSG2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ctdp1Q7TSG2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ctdp1Q7TSG2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ctdp1Q7TSG2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ctdp1Q7TSG2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ctdp1Q7TSG2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Ctdp1Q7TSG2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ctdp1Q7TSG2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ctdp1Q7TSG2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ctdp1Q7TSG2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Ctdp1Q7TSG2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ctdp1Q7TSG2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ctdp1Q7TSG2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ctdp1Q7TSG2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ctdp1Q7TSG2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Ctdp1Q7TSG2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ctdp1Q7TSG2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ctdp1Q7TSG2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ctdp1Q7TSG2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ctdp1Q7TSG2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Ctdp1Q7TSG2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Ctdp1Q7TSG2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ctdp1Q7TSG2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ctdp1Q7TSG2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ctdp1Q7TSG2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ctdp1Q7TSG2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ctdp1Q7TSG2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ctdp1Q7TSG2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ctdp1Q7TSG2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ctdp1Q7TSG2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ctdp1Q7TSG2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ctdp1Q7TSG2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ctdp1Q7TSG2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ctdp1Q7TSG2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ctdp1Q7TSG2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ctdp1Q7TSG2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Ctdp1Q7TSG2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ctdp1Q7TSG2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ctdp1Q7TSG2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ctdp1Q7TSG2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ctdp1Q7TSG2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ctdp1Q7TSG2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ctdp1Q7TSG2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Ctdp1Q7TSG2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ctdp1Q7TSG2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ctdp1Q7TSG2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ctdp1Q7TSG2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ctdp1Q7TSG2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ctdp1Q7TSG2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ctdp1Q7TSG2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ctdp1Q7TSG2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ctdp1Q7TSG2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ctdp1Q7TSG2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ctdp1Q7TSG2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ctdp1Q7TSG2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ctdp1Q7TSG2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ctdp1Q7TSG2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ctdp1Q7TSG2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ctdp1Q7TSG2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ctdp1Q7TSG2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ctdp1Q7TSG2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ctdp1Q7TSG2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ctdp1Q7TSG2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ctdp1Q7TSG2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ctdp1Q7TSG2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ctdp1Q7TSG2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ctdp1Q7TSG2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ctdp1Q7TSG2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms