Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ckap2lQ7TS74 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ckap2lQ7TS74 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ckap2lQ7TS74 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ckap2lQ7TS74 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ckap2lQ7TS74 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ckap2lQ7TS74 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ckap2lQ7TS74 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ckap2lQ7TS74 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ckap2lQ7TS74 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ckap2lQ7TS74 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ckap2lQ7TS74 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ckap2lQ7TS74 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ckap2lQ7TS74 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ckap2lQ7TS74 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ckap2lQ7TS74 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ckap2lQ7TS74 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ckap2lQ7TS74 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Ckap2lQ7TS74 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ckap2lQ7TS74 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ckap2lQ7TS74 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ckap2lQ7TS74 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ckap2lQ7TS74 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ckap2lQ7TS74 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ckap2lQ7TS74 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Ckap2lQ7TS74 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ckap2lQ7TS74 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ckap2lQ7TS74 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ckap2lQ7TS74 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ckap2lQ7TS74 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ckap2lQ7TS74 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ckap2lQ7TS74 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ckap2lQ7TS74 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ckap2lQ7TS74 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ckap2lQ7TS74 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ckap2lQ7TS74 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ckap2lQ7TS74 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ckap2lQ7TS74 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ckap2lQ7TS74 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ckap2lQ7TS74 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ckap2lQ7TS74 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ckap2lQ7TS74 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ckap2lQ7TS74 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ckap2lQ7TS74 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ckap2lQ7TS74 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ckap2lQ7TS74 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ckap2lQ7TS74 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ckap2lQ7TS74 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ckap2lQ7TS74 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ckap2lQ7TS74 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ckap2lQ7TS74 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ckap2lQ7TS74 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ckap2lQ7TS74 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ckap2lQ7TS74 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ckap2lQ7TS74 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ckap2lQ7TS74 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ckap2lQ7TS74 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ckap2lQ7TS74 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ckap2lQ7TS74 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ckap2lQ7TS74 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ckap2lQ7TS74 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ckap2lQ7TS74 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ckap2lQ7TS74 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ckap2lQ7TS74 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ckap2lQ7TS74 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ckap2lQ7TS74 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ckap2lQ7TS74 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ckap2lQ7TS74 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ckap2lQ7TS74 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ckap2lQ7TS74 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ckap2lQ7TS74 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ckap2lQ7TS74 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ckap2lQ7TS74 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ckap2lQ7TS74 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ckap2lQ7TS74 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ckap2lQ7TS74 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ckap2lQ7TS74 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ckap2lQ7TS74 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ckap2lQ7TS74 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ckap2lQ7TS74 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Ckap2lQ7TS74 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ckap2lQ7TS74 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ckap2lQ7TS74 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ckap2lQ7TS74 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ckap2lQ7TS74 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ckap2lQ7TS74 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ckap2lQ7TS74 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ckap2lQ7TS74 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ckap2lQ7TS74 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ckap2lQ7TS74 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ckap2lQ7TS74 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ckap2lQ7TS74 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ckap2lQ7TS74 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ckap2lQ7TS74 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ckap2lQ7TS74 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ckap2lQ7TS74 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ckap2lQ7TS74 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Ckap2lQ7TS74 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Ckap2lQ7TS74 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ckap2lQ7TS74 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms