Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HjurpQ6PG16 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HjurpQ6PG16 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HjurpQ6PG16 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HjurpQ6PG16 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HjurpQ6PG16 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HjurpQ6PG16 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HjurpQ6PG16 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HjurpQ6PG16 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HjurpQ6PG16 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HjurpQ6PG16 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
HjurpQ6PG16 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HjurpQ6PG16 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HjurpQ6PG16 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HjurpQ6PG16 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HjurpQ6PG16 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HjurpQ6PG16 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HjurpQ6PG16 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HjurpQ6PG16 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HjurpQ6PG16 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HjurpQ6PG16 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HjurpQ6PG16 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HjurpQ6PG16 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HjurpQ6PG16 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HjurpQ6PG16 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HjurpQ6PG16 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HjurpQ6PG16 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HjurpQ6PG16 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HjurpQ6PG16 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HjurpQ6PG16 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HjurpQ6PG16 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HjurpQ6PG16 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HjurpQ6PG16 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HjurpQ6PG16 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HjurpQ6PG16 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HjurpQ6PG16 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HjurpQ6PG16 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HjurpQ6PG16 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HjurpQ6PG16 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HjurpQ6PG16 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
HjurpQ6PG16 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HjurpQ6PG16 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HjurpQ6PG16 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HjurpQ6PG16 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HjurpQ6PG16 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HjurpQ6PG16 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HjurpQ6PG16 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
HjurpQ6PG16 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HjurpQ6PG16 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HjurpQ6PG16 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HjurpQ6PG16 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HjurpQ6PG16 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HjurpQ6PG16 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HjurpQ6PG16 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HjurpQ6PG16 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HjurpQ6PG16 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HjurpQ6PG16 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HjurpQ6PG16 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HjurpQ6PG16 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HjurpQ6PG16 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
HjurpQ6PG16 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HjurpQ6PG16 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HjurpQ6PG16 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HjurpQ6PG16 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HjurpQ6PG16 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HjurpQ6PG16 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HjurpQ6PG16 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HjurpQ6PG16 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HjurpQ6PG16 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HjurpQ6PG16 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HjurpQ6PG16 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HjurpQ6PG16 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
HjurpQ6PG16 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HjurpQ6PG16 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HjurpQ6PG16 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HjurpQ6PG16 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HjurpQ6PG16 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HjurpQ6PG16 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HjurpQ6PG16 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HjurpQ6PG16 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HjurpQ6PG16 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HjurpQ6PG16 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HjurpQ6PG16 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HjurpQ6PG16 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HjurpQ6PG16 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HjurpQ6PG16 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HjurpQ6PG16 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HjurpQ6PG16 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HjurpQ6PG16 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HjurpQ6PG16 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HjurpQ6PG16 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HjurpQ6PG16 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HjurpQ6PG16 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HjurpQ6PG16 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
HjurpQ6PG16 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HjurpQ6PG16 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HjurpQ6PG16 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HjurpQ6PG16 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HjurpQ6PG16 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HjurpQ6PG16 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms