Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A4

Vsig8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig8Q6P3A4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
Vsig8Q6P3A4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21,31■■□□□ 1
Vsig8Q6P3A4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Vsig8Q6P3A4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Vsig8Q6P3A4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21,27■■□□□ 1
Vsig8Q6P3A4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Vsig8Q6P3A4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Vsig8Q6P3A4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Vsig8Q6P3A4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21,24■□□□□ 0,99
Vsig8Q6P3A4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21,23■□□□□ 0,99
Vsig8Q6P3A4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
Vsig8Q6P3A4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21,21■□□□□ 0,99
Vsig8Q6P3A4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21,19■□□□□ 0,98
Vsig8Q6P3A4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Vsig8Q6P3A4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,97
Vsig8Q6P3A4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
Vsig8Q6P3A4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21,1■□□□□ 0,97
Vsig8Q6P3A4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,09■□□□□ 0,97
Vsig8Q6P3A4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Vsig8Q6P3A4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,97
Vsig8Q6P3A4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Vsig8Q6P3A4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21,06■□□□□ 0,96
Vsig8Q6P3A4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Vsig8Q6P3A4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21,04■□□□□ 0,96
Vsig8Q6P3A4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Vsig8Q6P3A4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Vsig8Q6P3A4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21,01■□□□□ 0,95
Vsig8Q6P3A4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Vsig8Q6P3A4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20,99■□□□□ 0,95
Vsig8Q6P3A4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20,98■□□□□ 0,95
Vsig8Q6P3A4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Vsig8Q6P3A4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Vsig8Q6P3A4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20,89■□□□□ 0,94
Vsig8Q6P3A4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20,89■□□□□ 0,93
Vsig8Q6P3A4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Vsig8Q6P3A4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Vsig8Q6P3A4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Vsig8Q6P3A4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Vsig8Q6P3A4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,84■□□□□ 0,93
Vsig8Q6P3A4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,93
Vsig8Q6P3A4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Vsig8Q6P3A4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,82■□□□□ 0,92
Vsig8Q6P3A4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Vsig8Q6P3A4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20,8■□□□□ 0,92
Vsig8Q6P3A4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Vsig8Q6P3A4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Vsig8Q6P3A4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Vsig8Q6P3A4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
Vsig8Q6P3A4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
Vsig8Q6P3A4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,75■□□□□ 0,91
Vsig8Q6P3A4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Vsig8Q6P3A4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20,69■□□□□ 0,9
Vsig8Q6P3A4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Vsig8Q6P3A4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Vsig8Q6P3A4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
Vsig8Q6P3A4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Vsig8Q6P3A4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Vsig8Q6P3A4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,89
Vsig8Q6P3A4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20,63■□□□□ 0,89
Vsig8Q6P3A4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Vsig8Q6P3A4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,61■□□□□ 0,89
Vsig8Q6P3A4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,61■□□□□ 0,89
Vsig8Q6P3A4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
Vsig8Q6P3A4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Vsig8Q6P3A4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20,59■□□□□ 0,89
Vsig8Q6P3A4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Vsig8Q6P3A4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,89
Vsig8Q6P3A4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20,57■□□□□ 0,88
Vsig8Q6P3A4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20,57■□□□□ 0,88
Vsig8Q6P3A4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
Vsig8Q6P3A4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,88
Vsig8Q6P3A4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Vsig8Q6P3A4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Vsig8Q6P3A4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20,49■□□□□ 0,87
Vsig8Q6P3A4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20,48■□□□□ 0,87
Vsig8Q6P3A4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Vsig8Q6P3A4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20,46■□□□□ 0,87
Vsig8Q6P3A4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Vsig8Q6P3A4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Vsig8Q6P3A4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Vsig8Q6P3A4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Vsig8Q6P3A4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Vsig8Q6P3A4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20,41■□□□□ 0,86
Vsig8Q6P3A4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Vsig8Q6P3A4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
Vsig8Q6P3A4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
Vsig8Q6P3A4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20,36■□□□□ 0,85
Vsig8Q6P3A4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
Vsig8Q6P3A4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,33■□□□□ 0,85
Vsig8Q6P3A4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20,33■□□□□ 0,85
Vsig8Q6P3A4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,33■□□□□ 0,85
Vsig8Q6P3A4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
Vsig8Q6P3A4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
Vsig8Q6P3A4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
Vsig8Q6P3A4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20,28■□□□□ 0,84
Vsig8Q6P3A4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20,27■□□□□ 0,83
Vsig8Q6P3A4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20,24■□□□□ 0,83
Vsig8Q6P3A4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,22■□□□□ 0,83
Vsig8Q6P3A4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20,22■□□□□ 0,83
Vsig8Q6P3A4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,21■□□□□ 0,83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16,8 ms