Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Tpm4Q6IRU2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Tpm4Q6IRU2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Tpm4Q6IRU2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Tpm4Q6IRU2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Tpm4Q6IRU2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Tpm4Q6IRU2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Tpm4Q6IRU2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Tpm4Q6IRU2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Tpm4Q6IRU2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tpm4Q6IRU2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Tpm4Q6IRU2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tpm4Q6IRU2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tpm4Q6IRU2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Tpm4Q6IRU2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Tpm4Q6IRU2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Tpm4Q6IRU2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Tpm4Q6IRU2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Tpm4Q6IRU2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Tpm4Q6IRU2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tpm4Q6IRU2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tpm4Q6IRU2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tpm4Q6IRU2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Tpm4Q6IRU2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Tpm4Q6IRU2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Tpm4Q6IRU2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Tpm4Q6IRU2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Tpm4Q6IRU2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Tpm4Q6IRU2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tpm4Q6IRU2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tpm4Q6IRU2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tpm4Q6IRU2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Tpm4Q6IRU2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Tpm4Q6IRU2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Tpm4Q6IRU2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Tpm4Q6IRU2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tpm4Q6IRU2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Tpm4Q6IRU2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tpm4Q6IRU2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Tpm4Q6IRU2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tpm4Q6IRU2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tpm4Q6IRU2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Tpm4Q6IRU2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Tpm4Q6IRU2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Tpm4Q6IRU2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tpm4Q6IRU2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tpm4Q6IRU2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Tpm4Q6IRU2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tpm4Q6IRU2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tpm4Q6IRU2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tpm4Q6IRU2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tpm4Q6IRU2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Tpm4Q6IRU2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tpm4Q6IRU2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tpm4Q6IRU2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tpm4Q6IRU2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tpm4Q6IRU2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tpm4Q6IRU2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tpm4Q6IRU2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tpm4Q6IRU2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tpm4Q6IRU2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tpm4Q6IRU2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tpm4Q6IRU2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tpm4Q6IRU2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tpm4Q6IRU2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tpm4Q6IRU2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Tpm4Q6IRU2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tpm4Q6IRU2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tpm4Q6IRU2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tpm4Q6IRU2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tpm4Q6IRU2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tpm4Q6IRU2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Tpm4Q6IRU2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tpm4Q6IRU2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tpm4Q6IRU2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tpm4Q6IRU2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tpm4Q6IRU2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tpm4Q6IRU2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tpm4Q6IRU2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tpm4Q6IRU2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Tpm4Q6IRU2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
Tpm4Q6IRU2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tpm4Q6IRU2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tpm4Q6IRU2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tpm4Q6IRU2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tpm4Q6IRU2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tpm4Q6IRU2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tpm4Q6IRU2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Tpm4Q6IRU2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tpm4Q6IRU2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Tpm4Q6IRU2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tpm4Q6IRU2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tpm4Q6IRU2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tpm4Q6IRU2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tpm4Q6IRU2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tpm4Q6IRU2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tpm4Q6IRU2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tpm4Q6IRU2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tpm4Q6IRU2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Tpm4Q6IRU2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms