Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE28

Gm5416, Predicted gene 5416, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5416Q6IE28 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm5416Q6IE28 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm5416Q6IE28 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm5416Q6IE28 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm5416Q6IE28 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm5416Q6IE28 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm5416Q6IE28 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm5416Q6IE28 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm5416Q6IE28 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm5416Q6IE28 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm5416Q6IE28 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm5416Q6IE28 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm5416Q6IE28 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm5416Q6IE28 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm5416Q6IE28 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm5416Q6IE28 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm5416Q6IE28 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm5416Q6IE28 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm5416Q6IE28 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm5416Q6IE28 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm5416Q6IE28 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm5416Q6IE28 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm5416Q6IE28 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm5416Q6IE28 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm5416Q6IE28 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm5416Q6IE28 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm5416Q6IE28 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm5416Q6IE28 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm5416Q6IE28 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm5416Q6IE28 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm5416Q6IE28 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm5416Q6IE28 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm5416Q6IE28 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gm5416Q6IE28 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm5416Q6IE28 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm5416Q6IE28 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm5416Q6IE28 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm5416Q6IE28 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm5416Q6IE28 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm5416Q6IE28 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm5416Q6IE28 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm5416Q6IE28 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm5416Q6IE28 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm5416Q6IE28 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm5416Q6IE28 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm5416Q6IE28 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm5416Q6IE28 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm5416Q6IE28 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm5416Q6IE28 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm5416Q6IE28 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm5416Q6IE28 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm5416Q6IE28 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm5416Q6IE28 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm5416Q6IE28 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm5416Q6IE28 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm5416Q6IE28 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm5416Q6IE28 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm5416Q6IE28 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm5416Q6IE28 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm5416Q6IE28 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm5416Q6IE28 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm5416Q6IE28 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm5416Q6IE28 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm5416Q6IE28 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm5416Q6IE28 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm5416Q6IE28 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm5416Q6IE28 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm5416Q6IE28 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm5416Q6IE28 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm5416Q6IE28 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm5416Q6IE28 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm5416Q6IE28 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm5416Q6IE28 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm5416Q6IE28 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm5416Q6IE28 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm5416Q6IE28 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm5416Q6IE28 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm5416Q6IE28 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm5416Q6IE28 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm5416Q6IE28 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm5416Q6IE28 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm5416Q6IE28 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm5416Q6IE28 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm5416Q6IE28 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gm5416Q6IE28 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gm5416Q6IE28 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm5416Q6IE28 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm5416Q6IE28 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm5416Q6IE28 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm5416Q6IE28 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm5416Q6IE28 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm5416Q6IE28 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm5416Q6IE28 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm5416Q6IE28 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm5416Q6IE28 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm5416Q6IE28 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm5416Q6IE28 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm5416Q6IE28 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm5416Q6IE28 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm5416Q6IE28 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms