Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ctnna3Q65CL1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ctnna3Q65CL1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ctnna3Q65CL1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ctnna3Q65CL1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ctnna3Q65CL1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ctnna3Q65CL1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ctnna3Q65CL1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ctnna3Q65CL1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ctnna3Q65CL1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ctnna3Q65CL1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ctnna3Q65CL1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ctnna3Q65CL1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ctnna3Q65CL1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ctnna3Q65CL1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ctnna3Q65CL1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ctnna3Q65CL1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ctnna3Q65CL1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ctnna3Q65CL1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ctnna3Q65CL1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ctnna3Q65CL1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ctnna3Q65CL1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ctnna3Q65CL1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ctnna3Q65CL1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ctnna3Q65CL1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ctnna3Q65CL1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ctnna3Q65CL1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ctnna3Q65CL1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ctnna3Q65CL1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ctnna3Q65CL1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Ctnna3Q65CL1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ctnna3Q65CL1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ctnna3Q65CL1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ctnna3Q65CL1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ctnna3Q65CL1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Ctnna3Q65CL1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ctnna3Q65CL1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ctnna3Q65CL1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ctnna3Q65CL1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ctnna3Q65CL1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ctnna3Q65CL1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Ctnna3Q65CL1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ctnna3Q65CL1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Ctnna3Q65CL1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ctnna3Q65CL1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ctnna3Q65CL1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ctnna3Q65CL1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ctnna3Q65CL1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ctnna3Q65CL1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ctnna3Q65CL1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ctnna3Q65CL1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ctnna3Q65CL1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ctnna3Q65CL1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ctnna3Q65CL1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ctnna3Q65CL1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ctnna3Q65CL1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ctnna3Q65CL1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ctnna3Q65CL1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ctnna3Q65CL1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ctnna3Q65CL1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Ctnna3Q65CL1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ctnna3Q65CL1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ctnna3Q65CL1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Ctnna3Q65CL1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ctnna3Q65CL1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ctnna3Q65CL1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ctnna3Q65CL1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ctnna3Q65CL1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ctnna3Q65CL1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ctnna3Q65CL1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ctnna3Q65CL1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ctnna3Q65CL1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Ctnna3Q65CL1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ctnna3Q65CL1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ctnna3Q65CL1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ctnna3Q65CL1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ctnna3Q65CL1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ctnna3Q65CL1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ctnna3Q65CL1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ctnna3Q65CL1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ctnna3Q65CL1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ctnna3Q65CL1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ctnna3Q65CL1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ctnna3Q65CL1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ctnna3Q65CL1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ctnna3Q65CL1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ctnna3Q65CL1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ctnna3Q65CL1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ctnna3Q65CL1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ctnna3Q65CL1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ctnna3Q65CL1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Ctnna3Q65CL1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ctnna3Q65CL1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ctnna3Q65CL1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ctnna3Q65CL1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ctnna3Q65CL1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ctnna3Q65CL1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ctnna3Q65CL1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ctnna3Q65CL1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ctnna3Q65CL1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms