Protein–RNA interactions for Protein: Q64221

Nhlh2, Helix-loop-helix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh2Q64221 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nhlh2Q64221 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Nhlh2Q64221 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nhlh2Q64221 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nhlh2Q64221 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nhlh2Q64221 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nhlh2Q64221 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nhlh2Q64221 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nhlh2Q64221 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nhlh2Q64221 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nhlh2Q64221 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nhlh2Q64221 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nhlh2Q64221 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nhlh2Q64221 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nhlh2Q64221 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nhlh2Q64221 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nhlh2Q64221 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Nhlh2Q64221 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nhlh2Q64221 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nhlh2Q64221 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nhlh2Q64221 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nhlh2Q64221 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nhlh2Q64221 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nhlh2Q64221 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Nhlh2Q64221 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nhlh2Q64221 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nhlh2Q64221 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nhlh2Q64221 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nhlh2Q64221 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nhlh2Q64221 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nhlh2Q64221 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nhlh2Q64221 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nhlh2Q64221 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nhlh2Q64221 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nhlh2Q64221 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nhlh2Q64221 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nhlh2Q64221 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nhlh2Q64221 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nhlh2Q64221 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nhlh2Q64221 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nhlh2Q64221 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Nhlh2Q64221 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nhlh2Q64221 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nhlh2Q64221 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nhlh2Q64221 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nhlh2Q64221 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nhlh2Q64221 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nhlh2Q64221 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nhlh2Q64221 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nhlh2Q64221 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nhlh2Q64221 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nhlh2Q64221 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nhlh2Q64221 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nhlh2Q64221 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nhlh2Q64221 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nhlh2Q64221 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nhlh2Q64221 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nhlh2Q64221 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nhlh2Q64221 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nhlh2Q64221 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nhlh2Q64221 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nhlh2Q64221 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nhlh2Q64221 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nhlh2Q64221 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nhlh2Q64221 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nhlh2Q64221 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nhlh2Q64221 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nhlh2Q64221 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Nhlh2Q64221 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Nhlh2Q64221 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nhlh2Q64221 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nhlh2Q64221 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nhlh2Q64221 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nhlh2Q64221 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nhlh2Q64221 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nhlh2Q64221 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nhlh2Q64221 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nhlh2Q64221 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nhlh2Q64221 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nhlh2Q64221 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nhlh2Q64221 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nhlh2Q64221 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nhlh2Q64221 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nhlh2Q64221 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nhlh2Q64221 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nhlh2Q64221 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nhlh2Q64221 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nhlh2Q64221 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nhlh2Q64221 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nhlh2Q64221 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nhlh2Q64221 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nhlh2Q64221 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nhlh2Q64221 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nhlh2Q64221 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nhlh2Q64221 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nhlh2Q64221 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nhlh2Q64221 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nhlh2Q64221 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nhlh2Q64221 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nhlh2Q64221 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms