Protein–RNA interactions for Protein: Q64028

Phc1, Polyhomeotic-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc1Q64028 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Phc1Q64028 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Phc1Q64028 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Phc1Q64028 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Phc1Q64028 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Phc1Q64028 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Phc1Q64028 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Phc1Q64028 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Phc1Q64028 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Phc1Q64028 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Phc1Q64028 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Phc1Q64028 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Phc1Q64028 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Phc1Q64028 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Phc1Q64028 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Phc1Q64028 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Phc1Q64028 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Phc1Q64028 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Phc1Q64028 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Phc1Q64028 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Phc1Q64028 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Phc1Q64028 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Phc1Q64028 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Phc1Q64028 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Phc1Q64028 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Phc1Q64028 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Phc1Q64028 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Phc1Q64028 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Phc1Q64028 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Phc1Q64028 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Phc1Q64028 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Phc1Q64028 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Phc1Q64028 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Phc1Q64028 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Phc1Q64028 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Phc1Q64028 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Phc1Q64028 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Phc1Q64028 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Phc1Q64028 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Phc1Q64028 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Phc1Q64028 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Phc1Q64028 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Phc1Q64028 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Phc1Q64028 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Phc1Q64028 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Phc1Q64028 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Phc1Q64028 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Phc1Q64028 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Phc1Q64028 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Phc1Q64028 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Phc1Q64028 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Phc1Q64028 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Phc1Q64028 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Phc1Q64028 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Phc1Q64028 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Phc1Q64028 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Phc1Q64028 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Phc1Q64028 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Phc1Q64028 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Phc1Q64028 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Phc1Q64028 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Phc1Q64028 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Phc1Q64028 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Phc1Q64028 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Phc1Q64028 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Phc1Q64028 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Phc1Q64028 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Phc1Q64028 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Phc1Q64028 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Phc1Q64028 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Phc1Q64028 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Phc1Q64028 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Phc1Q64028 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Phc1Q64028 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Phc1Q64028 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Phc1Q64028 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Phc1Q64028 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Phc1Q64028 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Phc1Q64028 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Phc1Q64028 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Phc1Q64028 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Phc1Q64028 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Phc1Q64028 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Phc1Q64028 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Phc1Q64028 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Phc1Q64028 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Phc1Q64028 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Phc1Q64028 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Phc1Q64028 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Phc1Q64028 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Phc1Q64028 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Phc1Q64028 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Phc1Q64028 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Phc1Q64028 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Phc1Q64028 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Phc1Q64028 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Phc1Q64028 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Phc1Q64028 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Phc1Q64028 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Phc1Q64028 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms