Protein–RNA interactions for Protein: Q61164

Ctcf, Transcriptional repressor CTCF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcfQ61164 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CtcfQ61164 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CtcfQ61164 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CtcfQ61164 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CtcfQ61164 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CtcfQ61164 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CtcfQ61164 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CtcfQ61164 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CtcfQ61164 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CtcfQ61164 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CtcfQ61164 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CtcfQ61164 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CtcfQ61164 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CtcfQ61164 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CtcfQ61164 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CtcfQ61164 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CtcfQ61164 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CtcfQ61164 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CtcfQ61164 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CtcfQ61164 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CtcfQ61164 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CtcfQ61164 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CtcfQ61164 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CtcfQ61164 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CtcfQ61164 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CtcfQ61164 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CtcfQ61164 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CtcfQ61164 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CtcfQ61164 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CtcfQ61164 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CtcfQ61164 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CtcfQ61164 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CtcfQ61164 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CtcfQ61164 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CtcfQ61164 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CtcfQ61164 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CtcfQ61164 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CtcfQ61164 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CtcfQ61164 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CtcfQ61164 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CtcfQ61164 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CtcfQ61164 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CtcfQ61164 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CtcfQ61164 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CtcfQ61164 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CtcfQ61164 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CtcfQ61164 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CtcfQ61164 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CtcfQ61164 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CtcfQ61164 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CtcfQ61164 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CtcfQ61164 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CtcfQ61164 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CtcfQ61164 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CtcfQ61164 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CtcfQ61164 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CtcfQ61164 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CtcfQ61164 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CtcfQ61164 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CtcfQ61164 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CtcfQ61164 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CtcfQ61164 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CtcfQ61164 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CtcfQ61164 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CtcfQ61164 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CtcfQ61164 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CtcfQ61164 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CtcfQ61164 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CtcfQ61164 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CtcfQ61164 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CtcfQ61164 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CtcfQ61164 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CtcfQ61164 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CtcfQ61164 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CtcfQ61164 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CtcfQ61164 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CtcfQ61164 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CtcfQ61164 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CtcfQ61164 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CtcfQ61164 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CtcfQ61164 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CtcfQ61164 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CtcfQ61164 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CtcfQ61164 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CtcfQ61164 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CtcfQ61164 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CtcfQ61164 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CtcfQ61164 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CtcfQ61164 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CtcfQ61164 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CtcfQ61164 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CtcfQ61164 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CtcfQ61164 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CtcfQ61164 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CtcfQ61164 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CtcfQ61164 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CtcfQ61164 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CtcfQ61164 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CtcfQ61164 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CtcfQ61164 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms