Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rbbp7Q60973 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rbbp7Q60973 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Rbbp7Q60973 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rbbp7Q60973 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rbbp7Q60973 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rbbp7Q60973 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rbbp7Q60973 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Rbbp7Q60973 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rbbp7Q60973 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rbbp7Q60973 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rbbp7Q60973 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rbbp7Q60973 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rbbp7Q60973 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Rbbp7Q60973 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rbbp7Q60973 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rbbp7Q60973 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rbbp7Q60973 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rbbp7Q60973 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rbbp7Q60973 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rbbp7Q60973 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rbbp7Q60973 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rbbp7Q60973 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rbbp7Q60973 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rbbp7Q60973 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rbbp7Q60973 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rbbp7Q60973 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Rbbp7Q60973 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rbbp7Q60973 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Rbbp7Q60973 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rbbp7Q60973 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rbbp7Q60973 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rbbp7Q60973 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rbbp7Q60973 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rbbp7Q60973 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rbbp7Q60973 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rbbp7Q60973 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rbbp7Q60973 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rbbp7Q60973 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rbbp7Q60973 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rbbp7Q60973 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rbbp7Q60973 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rbbp7Q60973 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Rbbp7Q60973 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rbbp7Q60973 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rbbp7Q60973 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rbbp7Q60973 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rbbp7Q60973 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rbbp7Q60973 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rbbp7Q60973 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rbbp7Q60973 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Rbbp7Q60973 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rbbp7Q60973 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rbbp7Q60973 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rbbp7Q60973 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rbbp7Q60973 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rbbp7Q60973 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rbbp7Q60973 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rbbp7Q60973 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rbbp7Q60973 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rbbp7Q60973 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rbbp7Q60973 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Rbbp7Q60973 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rbbp7Q60973 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Rbbp7Q60973 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rbbp7Q60973 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rbbp7Q60973 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rbbp7Q60973 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Rbbp7Q60973 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rbbp7Q60973 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rbbp7Q60973 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rbbp7Q60973 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rbbp7Q60973 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rbbp7Q60973 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rbbp7Q60973 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rbbp7Q60973 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rbbp7Q60973 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rbbp7Q60973 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rbbp7Q60973 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rbbp7Q60973 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rbbp7Q60973 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rbbp7Q60973 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rbbp7Q60973 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Rbbp7Q60973 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rbbp7Q60973 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rbbp7Q60973 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rbbp7Q60973 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Rbbp7Q60973 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rbbp7Q60973 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rbbp7Q60973 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rbbp7Q60973 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rbbp7Q60973 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rbbp7Q60973 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rbbp7Q60973 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Rbbp7Q60973 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rbbp7Q60973 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Rbbp7Q60973 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rbbp7Q60973 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Rbbp7Q60973 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rbbp7Q60973 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms