Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Fam71bQ5STT6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fam71bQ5STT6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fam71bQ5STT6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fam71bQ5STT6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fam71bQ5STT6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fam71bQ5STT6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fam71bQ5STT6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fam71bQ5STT6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Fam71bQ5STT6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Fam71bQ5STT6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Fam71bQ5STT6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Fam71bQ5STT6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Fam71bQ5STT6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Fam71bQ5STT6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Fam71bQ5STT6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Fam71bQ5STT6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Fam71bQ5STT6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Fam71bQ5STT6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Fam71bQ5STT6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Fam71bQ5STT6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Fam71bQ5STT6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Fam71bQ5STT6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Fam71bQ5STT6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fam71bQ5STT6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fam71bQ5STT6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fam71bQ5STT6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fam71bQ5STT6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fam71bQ5STT6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fam71bQ5STT6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fam71bQ5STT6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fam71bQ5STT6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Fam71bQ5STT6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fam71bQ5STT6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fam71bQ5STT6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fam71bQ5STT6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fam71bQ5STT6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fam71bQ5STT6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fam71bQ5STT6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fam71bQ5STT6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fam71bQ5STT6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fam71bQ5STT6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fam71bQ5STT6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fam71bQ5STT6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fam71bQ5STT6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fam71bQ5STT6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fam71bQ5STT6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fam71bQ5STT6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fam71bQ5STT6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fam71bQ5STT6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fam71bQ5STT6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fam71bQ5STT6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fam71bQ5STT6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fam71bQ5STT6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fam71bQ5STT6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Fam71bQ5STT6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fam71bQ5STT6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fam71bQ5STT6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Fam71bQ5STT6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fam71bQ5STT6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fam71bQ5STT6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fam71bQ5STT6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fam71bQ5STT6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Fam71bQ5STT6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fam71bQ5STT6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fam71bQ5STT6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fam71bQ5STT6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Fam71bQ5STT6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Fam71bQ5STT6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fam71bQ5STT6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fam71bQ5STT6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Fam71bQ5STT6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Fam71bQ5STT6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fam71bQ5STT6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fam71bQ5STT6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fam71bQ5STT6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fam71bQ5STT6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fam71bQ5STT6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fam71bQ5STT6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Fam71bQ5STT6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fam71bQ5STT6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fam71bQ5STT6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fam71bQ5STT6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fam71bQ5STT6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Fam71bQ5STT6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fam71bQ5STT6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fam71bQ5STT6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fam71bQ5STT6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fam71bQ5STT6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fam71bQ5STT6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fam71bQ5STT6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fam71bQ5STT6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fam71bQ5STT6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Fam71bQ5STT6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fam71bQ5STT6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fam71bQ5STT6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fam71bQ5STT6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fam71bQ5STT6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fam71bQ5STT6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fam71bQ5STT6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms