Protein–RNA interactions for Protein: Q5G866

Defa23, Alpha-defensin 23, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa23Q5G866 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa23Q5G866 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Defa23Q5G866 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Defa23Q5G866 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Defa23Q5G866 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa23Q5G866 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa23Q5G866 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa23Q5G866 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa23Q5G866 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa23Q5G866 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa23Q5G866 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa23Q5G866 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa23Q5G866 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa23Q5G866 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa23Q5G866 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa23Q5G866 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa23Q5G866 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa23Q5G866 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa23Q5G866 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa23Q5G866 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa23Q5G866 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa23Q5G866 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa23Q5G866 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa23Q5G866 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa23Q5G866 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa23Q5G866 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa23Q5G866 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa23Q5G866 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa23Q5G866 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa23Q5G866 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa23Q5G866 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa23Q5G866 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa23Q5G866 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa23Q5G866 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa23Q5G866 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa23Q5G866 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa23Q5G866 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa23Q5G866 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa23Q5G866 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa23Q5G866 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa23Q5G866 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa23Q5G866 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa23Q5G866 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa23Q5G866 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa23Q5G866 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa23Q5G866 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa23Q5G866 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Defa23Q5G866 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Defa23Q5G866 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa23Q5G866 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Defa23Q5G866 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Defa23Q5G866 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Defa23Q5G866 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa23Q5G866 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa23Q5G866 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa23Q5G866 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa23Q5G866 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa23Q5G866 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa23Q5G866 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa23Q5G866 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Defa23Q5G866 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa23Q5G866 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Defa23Q5G866 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Defa23Q5G866 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Defa23Q5G866 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa23Q5G866 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa23Q5G866 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa23Q5G866 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa23Q5G866 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa23Q5G866 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa23Q5G866 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa23Q5G866 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa23Q5G866 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa23Q5G866 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa23Q5G866 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa23Q5G866 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa23Q5G866 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa23Q5G866 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa23Q5G866 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa23Q5G866 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa23Q5G866 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa23Q5G866 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa23Q5G866 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa23Q5G866 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa23Q5G866 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa23Q5G866 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa23Q5G866 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa23Q5G866 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa23Q5G866 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa23Q5G866 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa23Q5G866 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa23Q5G866 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa23Q5G866 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa23Q5G866 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa23Q5G866 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa23Q5G866 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa23Q5G866 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa23Q5G866 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa23Q5G866 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa23Q5G866 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms