Protein–RNA interactions for Protein: Q3V016

Hipk4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk4Q3V016 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hipk4Q3V016 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hipk4Q3V016 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hipk4Q3V016 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hipk4Q3V016 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hipk4Q3V016 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hipk4Q3V016 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hipk4Q3V016 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hipk4Q3V016 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hipk4Q3V016 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hipk4Q3V016 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hipk4Q3V016 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Hipk4Q3V016 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hipk4Q3V016 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hipk4Q3V016 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Hipk4Q3V016 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hipk4Q3V016 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hipk4Q3V016 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hipk4Q3V016 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hipk4Q3V016 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hipk4Q3V016 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hipk4Q3V016 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hipk4Q3V016 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hipk4Q3V016 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hipk4Q3V016 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hipk4Q3V016 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hipk4Q3V016 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hipk4Q3V016 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hipk4Q3V016 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hipk4Q3V016 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hipk4Q3V016 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hipk4Q3V016 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hipk4Q3V016 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hipk4Q3V016 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hipk4Q3V016 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Hipk4Q3V016 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hipk4Q3V016 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hipk4Q3V016 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hipk4Q3V016 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hipk4Q3V016 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Hipk4Q3V016 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hipk4Q3V016 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Hipk4Q3V016 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Hipk4Q3V016 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Hipk4Q3V016 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hipk4Q3V016 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hipk4Q3V016 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hipk4Q3V016 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hipk4Q3V016 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hipk4Q3V016 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hipk4Q3V016 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hipk4Q3V016 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hipk4Q3V016 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hipk4Q3V016 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hipk4Q3V016 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hipk4Q3V016 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hipk4Q3V016 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hipk4Q3V016 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Hipk4Q3V016 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hipk4Q3V016 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hipk4Q3V016 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hipk4Q3V016 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Hipk4Q3V016 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hipk4Q3V016 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hipk4Q3V016 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hipk4Q3V016 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Hipk4Q3V016 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hipk4Q3V016 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Hipk4Q3V016 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hipk4Q3V016 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hipk4Q3V016 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hipk4Q3V016 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hipk4Q3V016 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hipk4Q3V016 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hipk4Q3V016 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hipk4Q3V016 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hipk4Q3V016 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hipk4Q3V016 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hipk4Q3V016 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hipk4Q3V016 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hipk4Q3V016 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hipk4Q3V016 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hipk4Q3V016 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hipk4Q3V016 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hipk4Q3V016 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hipk4Q3V016 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hipk4Q3V016 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hipk4Q3V016 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hipk4Q3V016 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hipk4Q3V016 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hipk4Q3V016 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hipk4Q3V016 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hipk4Q3V016 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hipk4Q3V016 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hipk4Q3V016 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hipk4Q3V016 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hipk4Q3V016 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hipk4Q3V016 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hipk4Q3V016 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hipk4Q3V016 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.7 ms