Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mbd3l2Q3UXB0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mbd3l2Q3UXB0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mbd3l2Q3UXB0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mbd3l2Q3UXB0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mbd3l2Q3UXB0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mbd3l2Q3UXB0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mbd3l2Q3UXB0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mbd3l2Q3UXB0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mbd3l2Q3UXB0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mbd3l2Q3UXB0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mbd3l2Q3UXB0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Mbd3l2Q3UXB0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mbd3l2Q3UXB0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mbd3l2Q3UXB0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mbd3l2Q3UXB0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mbd3l2Q3UXB0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mbd3l2Q3UXB0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mbd3l2Q3UXB0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mbd3l2Q3UXB0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mbd3l2Q3UXB0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Mbd3l2Q3UXB0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mbd3l2Q3UXB0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mbd3l2Q3UXB0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mbd3l2Q3UXB0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mbd3l2Q3UXB0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mbd3l2Q3UXB0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mbd3l2Q3UXB0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mbd3l2Q3UXB0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mbd3l2Q3UXB0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mbd3l2Q3UXB0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mbd3l2Q3UXB0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mbd3l2Q3UXB0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mbd3l2Q3UXB0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mbd3l2Q3UXB0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mbd3l2Q3UXB0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mbd3l2Q3UXB0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mbd3l2Q3UXB0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mbd3l2Q3UXB0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mbd3l2Q3UXB0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mbd3l2Q3UXB0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mbd3l2Q3UXB0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mbd3l2Q3UXB0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mbd3l2Q3UXB0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mbd3l2Q3UXB0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mbd3l2Q3UXB0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mbd3l2Q3UXB0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mbd3l2Q3UXB0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd3l2Q3UXB0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd3l2Q3UXB0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd3l2Q3UXB0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mbd3l2Q3UXB0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mbd3l2Q3UXB0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mbd3l2Q3UXB0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mbd3l2Q3UXB0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mbd3l2Q3UXB0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Mbd3l2Q3UXB0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mbd3l2Q3UXB0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mbd3l2Q3UXB0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mbd3l2Q3UXB0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mbd3l2Q3UXB0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mbd3l2Q3UXB0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mbd3l2Q3UXB0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms