Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmem253Q3UNB8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmem253Q3UNB8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmem253Q3UNB8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmem253Q3UNB8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmem253Q3UNB8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmem253Q3UNB8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmem253Q3UNB8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmem253Q3UNB8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmem253Q3UNB8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmem253Q3UNB8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmem253Q3UNB8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmem253Q3UNB8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmem253Q3UNB8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmem253Q3UNB8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmem253Q3UNB8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmem253Q3UNB8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem253Q3UNB8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem253Q3UNB8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tmem253Q3UNB8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmem253Q3UNB8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmem253Q3UNB8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmem253Q3UNB8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmem253Q3UNB8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmem253Q3UNB8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem253Q3UNB8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem253Q3UNB8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmem253Q3UNB8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem253Q3UNB8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmem253Q3UNB8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmem253Q3UNB8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tmem253Q3UNB8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmem253Q3UNB8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmem253Q3UNB8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmem253Q3UNB8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmem253Q3UNB8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmem253Q3UNB8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmem253Q3UNB8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmem253Q3UNB8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmem253Q3UNB8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmem253Q3UNB8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmem253Q3UNB8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmem253Q3UNB8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmem253Q3UNB8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmem253Q3UNB8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmem253Q3UNB8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmem253Q3UNB8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmem253Q3UNB8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmem253Q3UNB8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmem253Q3UNB8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmem253Q3UNB8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmem253Q3UNB8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmem253Q3UNB8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem253Q3UNB8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem253Q3UNB8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem253Q3UNB8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tmem253Q3UNB8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tmem253Q3UNB8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmem253Q3UNB8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmem253Q3UNB8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmem253Q3UNB8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmem253Q3UNB8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmem253Q3UNB8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmem253Q3UNB8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmem253Q3UNB8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmem253Q3UNB8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmem253Q3UNB8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmem253Q3UNB8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmem253Q3UNB8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tmem253Q3UNB8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmem253Q3UNB8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmem253Q3UNB8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmem253Q3UNB8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmem253Q3UNB8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmem253Q3UNB8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmem253Q3UNB8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmem253Q3UNB8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmem253Q3UNB8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem253Q3UNB8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem253Q3UNB8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem253Q3UNB8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem253Q3UNB8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmem253Q3UNB8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tmem253Q3UNB8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem253Q3UNB8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem253Q3UNB8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmem253Q3UNB8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmem253Q3UNB8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem253Q3UNB8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmem253Q3UNB8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmem253Q3UNB8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem253Q3UNB8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem253Q3UNB8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem253Q3UNB8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem253Q3UNB8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem253Q3UNB8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem253Q3UNB8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem253Q3UNB8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem253Q3UNB8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem253Q3UNB8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms