Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm648Q3UJ22 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm648Q3UJ22 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm648Q3UJ22 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm648Q3UJ22 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm648Q3UJ22 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm648Q3UJ22 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm648Q3UJ22 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm648Q3UJ22 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm648Q3UJ22 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm648Q3UJ22 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm648Q3UJ22 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm648Q3UJ22 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm648Q3UJ22 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm648Q3UJ22 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm648Q3UJ22 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm648Q3UJ22 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm648Q3UJ22 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm648Q3UJ22 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm648Q3UJ22 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm648Q3UJ22 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm648Q3UJ22 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm648Q3UJ22 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm648Q3UJ22 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm648Q3UJ22 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm648Q3UJ22 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm648Q3UJ22 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm648Q3UJ22 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm648Q3UJ22 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm648Q3UJ22 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm648Q3UJ22 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm648Q3UJ22 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm648Q3UJ22 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm648Q3UJ22 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm648Q3UJ22 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm648Q3UJ22 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm648Q3UJ22 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm648Q3UJ22 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm648Q3UJ22 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm648Q3UJ22 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm648Q3UJ22 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm648Q3UJ22 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm648Q3UJ22 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm648Q3UJ22 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm648Q3UJ22 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm648Q3UJ22 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm648Q3UJ22 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm648Q3UJ22 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm648Q3UJ22 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm648Q3UJ22 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm648Q3UJ22 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm648Q3UJ22 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm648Q3UJ22 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm648Q3UJ22 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm648Q3UJ22 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm648Q3UJ22 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm648Q3UJ22 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm648Q3UJ22 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm648Q3UJ22 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm648Q3UJ22 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm648Q3UJ22 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm648Q3UJ22 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm648Q3UJ22 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm648Q3UJ22 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm648Q3UJ22 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm648Q3UJ22 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm648Q3UJ22 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm648Q3UJ22 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm648Q3UJ22 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm648Q3UJ22 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm648Q3UJ22 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm648Q3UJ22 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm648Q3UJ22 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm648Q3UJ22 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm648Q3UJ22 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm648Q3UJ22 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm648Q3UJ22 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm648Q3UJ22 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm648Q3UJ22 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm648Q3UJ22 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm648Q3UJ22 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm648Q3UJ22 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm648Q3UJ22 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm648Q3UJ22 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm648Q3UJ22 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm648Q3UJ22 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm648Q3UJ22 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm648Q3UJ22 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm648Q3UJ22 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm648Q3UJ22 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm648Q3UJ22 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm648Q3UJ22 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm648Q3UJ22 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm648Q3UJ22 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm648Q3UJ22 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm648Q3UJ22 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm648Q3UJ22 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm648Q3UJ22 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm648Q3UJ22 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm648Q3UJ22 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms