Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lrrc58Q3UGP9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lrrc58Q3UGP9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lrrc58Q3UGP9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lrrc58Q3UGP9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lrrc58Q3UGP9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lrrc58Q3UGP9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Lrrc58Q3UGP9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lrrc58Q3UGP9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lrrc58Q3UGP9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lrrc58Q3UGP9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lrrc58Q3UGP9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lrrc58Q3UGP9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lrrc58Q3UGP9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lrrc58Q3UGP9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lrrc58Q3UGP9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lrrc58Q3UGP9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lrrc58Q3UGP9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lrrc58Q3UGP9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lrrc58Q3UGP9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lrrc58Q3UGP9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Lrrc58Q3UGP9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lrrc58Q3UGP9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lrrc58Q3UGP9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lrrc58Q3UGP9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrrc58Q3UGP9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrrc58Q3UGP9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lrrc58Q3UGP9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lrrc58Q3UGP9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrrc58Q3UGP9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lrrc58Q3UGP9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Lrrc58Q3UGP9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lrrc58Q3UGP9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lrrc58Q3UGP9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lrrc58Q3UGP9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lrrc58Q3UGP9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Lrrc58Q3UGP9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lrrc58Q3UGP9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lrrc58Q3UGP9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lrrc58Q3UGP9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lrrc58Q3UGP9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lrrc58Q3UGP9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lrrc58Q3UGP9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lrrc58Q3UGP9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lrrc58Q3UGP9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lrrc58Q3UGP9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lrrc58Q3UGP9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Lrrc58Q3UGP9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lrrc58Q3UGP9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lrrc58Q3UGP9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lrrc58Q3UGP9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lrrc58Q3UGP9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lrrc58Q3UGP9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lrrc58Q3UGP9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lrrc58Q3UGP9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrrc58Q3UGP9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrrc58Q3UGP9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrrc58Q3UGP9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrrc58Q3UGP9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrrc58Q3UGP9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Lrrc58Q3UGP9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lrrc58Q3UGP9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Lrrc58Q3UGP9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrrc58Q3UGP9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Lrrc58Q3UGP9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Lrrc58Q3UGP9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrrc58Q3UGP9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrrc58Q3UGP9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lrrc58Q3UGP9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lrrc58Q3UGP9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lrrc58Q3UGP9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lrrc58Q3UGP9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lrrc58Q3UGP9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrrc58Q3UGP9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrrc58Q3UGP9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrrc58Q3UGP9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrrc58Q3UGP9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrrc58Q3UGP9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lrrc58Q3UGP9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrrc58Q3UGP9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrrc58Q3UGP9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrrc58Q3UGP9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrrc58Q3UGP9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrrc58Q3UGP9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrrc58Q3UGP9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lrrc58Q3UGP9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Lrrc58Q3UGP9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrrc58Q3UGP9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrrc58Q3UGP9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrrc58Q3UGP9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lrrc58Q3UGP9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrrc58Q3UGP9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrrc58Q3UGP9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrrc58Q3UGP9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrc58Q3UGP9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrc58Q3UGP9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrrc58Q3UGP9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrrc58Q3UGP9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrrc58Q3UGP9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrrc58Q3UGP9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms