Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA16

Spc25, Kinetochore protein Spc25, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spc25Q3UA16 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Spc25Q3UA16 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Spc25Q3UA16 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Spc25Q3UA16 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Spc25Q3UA16 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Spc25Q3UA16 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Spc25Q3UA16 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Spc25Q3UA16 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Spc25Q3UA16 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Spc25Q3UA16 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Spc25Q3UA16 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Spc25Q3UA16 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Spc25Q3UA16 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Spc25Q3UA16 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Spc25Q3UA16 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Spc25Q3UA16 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Spc25Q3UA16 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Spc25Q3UA16 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Spc25Q3UA16 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Spc25Q3UA16 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Spc25Q3UA16 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spc25Q3UA16 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Spc25Q3UA16 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spc25Q3UA16 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spc25Q3UA16 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spc25Q3UA16 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spc25Q3UA16 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Spc25Q3UA16 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spc25Q3UA16 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spc25Q3UA16 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spc25Q3UA16 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spc25Q3UA16 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Spc25Q3UA16 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spc25Q3UA16 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spc25Q3UA16 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spc25Q3UA16 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spc25Q3UA16 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spc25Q3UA16 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Spc25Q3UA16 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spc25Q3UA16 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spc25Q3UA16 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Spc25Q3UA16 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spc25Q3UA16 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spc25Q3UA16 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spc25Q3UA16 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spc25Q3UA16 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spc25Q3UA16 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spc25Q3UA16 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Spc25Q3UA16 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spc25Q3UA16 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spc25Q3UA16 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spc25Q3UA16 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spc25Q3UA16 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spc25Q3UA16 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Spc25Q3UA16 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Spc25Q3UA16 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Spc25Q3UA16 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Spc25Q3UA16 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spc25Q3UA16 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Spc25Q3UA16 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Spc25Q3UA16 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Spc25Q3UA16 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spc25Q3UA16 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Spc25Q3UA16 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Spc25Q3UA16 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Spc25Q3UA16 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Spc25Q3UA16 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spc25Q3UA16 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spc25Q3UA16 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spc25Q3UA16 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spc25Q3UA16 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Spc25Q3UA16 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Spc25Q3UA16 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spc25Q3UA16 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Spc25Q3UA16 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Spc25Q3UA16 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spc25Q3UA16 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spc25Q3UA16 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Spc25Q3UA16 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Spc25Q3UA16 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Spc25Q3UA16 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Spc25Q3UA16 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Spc25Q3UA16 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Spc25Q3UA16 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Spc25Q3UA16 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Spc25Q3UA16 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Spc25Q3UA16 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Spc25Q3UA16 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Spc25Q3UA16 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Spc25Q3UA16 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Spc25Q3UA16 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Spc25Q3UA16 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Spc25Q3UA16 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Spc25Q3UA16 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spc25Q3UA16 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spc25Q3UA16 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spc25Q3UA16 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spc25Q3UA16 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spc25Q3UA16 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spc25Q3UA16 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms