Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TchpQ3TVW5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TchpQ3TVW5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TchpQ3TVW5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TchpQ3TVW5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TchpQ3TVW5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TchpQ3TVW5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TchpQ3TVW5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TchpQ3TVW5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TchpQ3TVW5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TchpQ3TVW5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TchpQ3TVW5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TchpQ3TVW5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TchpQ3TVW5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TchpQ3TVW5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TchpQ3TVW5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TchpQ3TVW5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TchpQ3TVW5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TchpQ3TVW5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TchpQ3TVW5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TchpQ3TVW5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TchpQ3TVW5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TchpQ3TVW5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TchpQ3TVW5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TchpQ3TVW5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TchpQ3TVW5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TchpQ3TVW5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TchpQ3TVW5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TchpQ3TVW5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TchpQ3TVW5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TchpQ3TVW5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TchpQ3TVW5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TchpQ3TVW5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TchpQ3TVW5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TchpQ3TVW5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TchpQ3TVW5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TchpQ3TVW5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TchpQ3TVW5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TchpQ3TVW5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TchpQ3TVW5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TchpQ3TVW5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TchpQ3TVW5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TchpQ3TVW5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TchpQ3TVW5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TchpQ3TVW5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TchpQ3TVW5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TchpQ3TVW5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TchpQ3TVW5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TchpQ3TVW5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TchpQ3TVW5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TchpQ3TVW5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TchpQ3TVW5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TchpQ3TVW5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TchpQ3TVW5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TchpQ3TVW5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TchpQ3TVW5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TchpQ3TVW5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TchpQ3TVW5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TchpQ3TVW5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TchpQ3TVW5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TchpQ3TVW5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TchpQ3TVW5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TchpQ3TVW5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TchpQ3TVW5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TchpQ3TVW5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TchpQ3TVW5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TchpQ3TVW5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TchpQ3TVW5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TchpQ3TVW5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TchpQ3TVW5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TchpQ3TVW5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TchpQ3TVW5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TchpQ3TVW5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TchpQ3TVW5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TchpQ3TVW5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TchpQ3TVW5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TchpQ3TVW5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TchpQ3TVW5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TchpQ3TVW5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TchpQ3TVW5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TchpQ3TVW5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TchpQ3TVW5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TchpQ3TVW5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TchpQ3TVW5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TchpQ3TVW5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TchpQ3TVW5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TchpQ3TVW5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TchpQ3TVW5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TchpQ3TVW5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TchpQ3TVW5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TchpQ3TVW5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TchpQ3TVW5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TchpQ3TVW5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TchpQ3TVW5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TchpQ3TVW5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TchpQ3TVW5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TchpQ3TVW5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TchpQ3TVW5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TchpQ3TVW5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TchpQ3TVW5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms