Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR2

Xlr4c, X-linked lymphocyte-regulated 4C, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr4cQ3TKR2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Xlr4cQ3TKR2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Xlr4cQ3TKR2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Xlr4cQ3TKR2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Xlr4cQ3TKR2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Xlr4cQ3TKR2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Xlr4cQ3TKR2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Xlr4cQ3TKR2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Xlr4cQ3TKR2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Xlr4cQ3TKR2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Xlr4cQ3TKR2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Xlr4cQ3TKR2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Xlr4cQ3TKR2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Xlr4cQ3TKR2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Xlr4cQ3TKR2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Xlr4cQ3TKR2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Xlr4cQ3TKR2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Xlr4cQ3TKR2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Xlr4cQ3TKR2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Xlr4cQ3TKR2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Xlr4cQ3TKR2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Xlr4cQ3TKR2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Xlr4cQ3TKR2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Xlr4cQ3TKR2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Xlr4cQ3TKR2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Xlr4cQ3TKR2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Xlr4cQ3TKR2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Xlr4cQ3TKR2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Xlr4cQ3TKR2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Xlr4cQ3TKR2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Xlr4cQ3TKR2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Xlr4cQ3TKR2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Xlr4cQ3TKR2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Xlr4cQ3TKR2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Xlr4cQ3TKR2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Xlr4cQ3TKR2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Xlr4cQ3TKR2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Xlr4cQ3TKR2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Xlr4cQ3TKR2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Xlr4cQ3TKR2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Xlr4cQ3TKR2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Xlr4cQ3TKR2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Xlr4cQ3TKR2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Xlr4cQ3TKR2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Xlr4cQ3TKR2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Xlr4cQ3TKR2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Xlr4cQ3TKR2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Xlr4cQ3TKR2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Xlr4cQ3TKR2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Xlr4cQ3TKR2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Xlr4cQ3TKR2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Xlr4cQ3TKR2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Xlr4cQ3TKR2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Xlr4cQ3TKR2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Xlr4cQ3TKR2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Xlr4cQ3TKR2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Xlr4cQ3TKR2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Xlr4cQ3TKR2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Xlr4cQ3TKR2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Xlr4cQ3TKR2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Xlr4cQ3TKR2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Xlr4cQ3TKR2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Xlr4cQ3TKR2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Xlr4cQ3TKR2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Xlr4cQ3TKR2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Xlr4cQ3TKR2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Xlr4cQ3TKR2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Xlr4cQ3TKR2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Xlr4cQ3TKR2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Xlr4cQ3TKR2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Xlr4cQ3TKR2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Xlr4cQ3TKR2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Xlr4cQ3TKR2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Xlr4cQ3TKR2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Xlr4cQ3TKR2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Xlr4cQ3TKR2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Xlr4cQ3TKR2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Xlr4cQ3TKR2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Xlr4cQ3TKR2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Xlr4cQ3TKR2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Xlr4cQ3TKR2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Xlr4cQ3TKR2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Xlr4cQ3TKR2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Xlr4cQ3TKR2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Xlr4cQ3TKR2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Xlr4cQ3TKR2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Xlr4cQ3TKR2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Xlr4cQ3TKR2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xlr4cQ3TKR2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xlr4cQ3TKR2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xlr4cQ3TKR2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xlr4cQ3TKR2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Xlr4cQ3TKR2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xlr4cQ3TKR2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Xlr4cQ3TKR2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xlr4cQ3TKR2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Xlr4cQ3TKR2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xlr4cQ3TKR2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xlr4cQ3TKR2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xlr4cQ3TKR2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms