Protein–RNA interactions for Protein: Q3TEA8

Hp1bp3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hp1bp3Q3TEA8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hp1bp3Q3TEA8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hp1bp3Q3TEA8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hp1bp3Q3TEA8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hp1bp3Q3TEA8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hp1bp3Q3TEA8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hp1bp3Q3TEA8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Hp1bp3Q3TEA8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Hp1bp3Q3TEA8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hp1bp3Q3TEA8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hp1bp3Q3TEA8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hp1bp3Q3TEA8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hp1bp3Q3TEA8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hp1bp3Q3TEA8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hp1bp3Q3TEA8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hp1bp3Q3TEA8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hp1bp3Q3TEA8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hp1bp3Q3TEA8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hp1bp3Q3TEA8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hp1bp3Q3TEA8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hp1bp3Q3TEA8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hp1bp3Q3TEA8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hp1bp3Q3TEA8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hp1bp3Q3TEA8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hp1bp3Q3TEA8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hp1bp3Q3TEA8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hp1bp3Q3TEA8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Hp1bp3Q3TEA8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Hp1bp3Q3TEA8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hp1bp3Q3TEA8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hp1bp3Q3TEA8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hp1bp3Q3TEA8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hp1bp3Q3TEA8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hp1bp3Q3TEA8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hp1bp3Q3TEA8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hp1bp3Q3TEA8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hp1bp3Q3TEA8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hp1bp3Q3TEA8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hp1bp3Q3TEA8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hp1bp3Q3TEA8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hp1bp3Q3TEA8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hp1bp3Q3TEA8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hp1bp3Q3TEA8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hp1bp3Q3TEA8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hp1bp3Q3TEA8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hp1bp3Q3TEA8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hp1bp3Q3TEA8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Hp1bp3Q3TEA8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hp1bp3Q3TEA8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hp1bp3Q3TEA8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Hp1bp3Q3TEA8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hp1bp3Q3TEA8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Hp1bp3Q3TEA8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Hp1bp3Q3TEA8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hp1bp3Q3TEA8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Hp1bp3Q3TEA8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hp1bp3Q3TEA8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hp1bp3Q3TEA8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hp1bp3Q3TEA8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hp1bp3Q3TEA8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hp1bp3Q3TEA8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hp1bp3Q3TEA8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hp1bp3Q3TEA8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hp1bp3Q3TEA8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hp1bp3Q3TEA8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hp1bp3Q3TEA8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hp1bp3Q3TEA8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hp1bp3Q3TEA8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hp1bp3Q3TEA8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hp1bp3Q3TEA8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hp1bp3Q3TEA8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hp1bp3Q3TEA8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hp1bp3Q3TEA8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hp1bp3Q3TEA8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hp1bp3Q3TEA8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hp1bp3Q3TEA8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hp1bp3Q3TEA8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hp1bp3Q3TEA8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hp1bp3Q3TEA8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Hp1bp3Q3TEA8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hp1bp3Q3TEA8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hp1bp3Q3TEA8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hp1bp3Q3TEA8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Hp1bp3Q3TEA8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hp1bp3Q3TEA8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hp1bp3Q3TEA8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hp1bp3Q3TEA8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hp1bp3Q3TEA8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Hp1bp3Q3TEA8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hp1bp3Q3TEA8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hp1bp3Q3TEA8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hp1bp3Q3TEA8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hp1bp3Q3TEA8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hp1bp3Q3TEA8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hp1bp3Q3TEA8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hp1bp3Q3TEA8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Hp1bp3Q3TEA8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hp1bp3Q3TEA8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hp1bp3Q3TEA8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hp1bp3Q3TEA8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms