Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC33

Ccdc127, Coiled-coil domain-containing protein 127, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc127Q3TC33 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc127Q3TC33 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc127Q3TC33 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc127Q3TC33 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc127Q3TC33 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc127Q3TC33 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc127Q3TC33 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc127Q3TC33 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc127Q3TC33 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc127Q3TC33 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc127Q3TC33 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc127Q3TC33 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc127Q3TC33 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccdc127Q3TC33 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc127Q3TC33 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc127Q3TC33 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc127Q3TC33 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc127Q3TC33 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc127Q3TC33 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc127Q3TC33 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc127Q3TC33 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc127Q3TC33 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccdc127Q3TC33 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc127Q3TC33 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc127Q3TC33 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc127Q3TC33 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc127Q3TC33 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc127Q3TC33 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc127Q3TC33 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc127Q3TC33 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc127Q3TC33 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc127Q3TC33 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc127Q3TC33 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc127Q3TC33 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc127Q3TC33 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc127Q3TC33 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc127Q3TC33 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc127Q3TC33 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc127Q3TC33 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc127Q3TC33 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc127Q3TC33 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc127Q3TC33 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc127Q3TC33 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc127Q3TC33 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc127Q3TC33 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc127Q3TC33 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc127Q3TC33 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc127Q3TC33 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc127Q3TC33 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc127Q3TC33 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc127Q3TC33 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc127Q3TC33 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc127Q3TC33 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc127Q3TC33 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc127Q3TC33 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc127Q3TC33 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc127Q3TC33 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc127Q3TC33 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc127Q3TC33 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc127Q3TC33 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc127Q3TC33 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc127Q3TC33 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc127Q3TC33 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc127Q3TC33 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc127Q3TC33 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc127Q3TC33 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc127Q3TC33 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc127Q3TC33 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc127Q3TC33 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc127Q3TC33 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc127Q3TC33 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc127Q3TC33 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc127Q3TC33 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc127Q3TC33 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc127Q3TC33 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc127Q3TC33 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc127Q3TC33 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc127Q3TC33 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc127Q3TC33 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc127Q3TC33 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc127Q3TC33 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc127Q3TC33 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc127Q3TC33 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc127Q3TC33 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc127Q3TC33 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc127Q3TC33 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc127Q3TC33 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc127Q3TC33 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc127Q3TC33 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc127Q3TC33 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc127Q3TC33 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc127Q3TC33 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc127Q3TC33 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc127Q3TC33 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc127Q3TC33 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc127Q3TC33 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc127Q3TC33 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc127Q3TC33 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc127Q3TC33 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc127Q3TC33 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms