Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpusd3Q14AI6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpusd3Q14AI6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpusd3Q14AI6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpusd3Q14AI6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpusd3Q14AI6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpusd3Q14AI6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpusd3Q14AI6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpusd3Q14AI6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpusd3Q14AI6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpusd3Q14AI6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpusd3Q14AI6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpusd3Q14AI6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpusd3Q14AI6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpusd3Q14AI6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpusd3Q14AI6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpusd3Q14AI6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpusd3Q14AI6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpusd3Q14AI6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpusd3Q14AI6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rpusd3Q14AI6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpusd3Q14AI6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpusd3Q14AI6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpusd3Q14AI6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpusd3Q14AI6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpusd3Q14AI6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpusd3Q14AI6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpusd3Q14AI6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpusd3Q14AI6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpusd3Q14AI6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpusd3Q14AI6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpusd3Q14AI6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpusd3Q14AI6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpusd3Q14AI6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpusd3Q14AI6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpusd3Q14AI6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpusd3Q14AI6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpusd3Q14AI6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpusd3Q14AI6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpusd3Q14AI6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpusd3Q14AI6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpusd3Q14AI6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpusd3Q14AI6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpusd3Q14AI6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpusd3Q14AI6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpusd3Q14AI6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpusd3Q14AI6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpusd3Q14AI6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpusd3Q14AI6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpusd3Q14AI6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpusd3Q14AI6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpusd3Q14AI6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpusd3Q14AI6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpusd3Q14AI6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpusd3Q14AI6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rpusd3Q14AI6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpusd3Q14AI6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpusd3Q14AI6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpusd3Q14AI6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpusd3Q14AI6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpusd3Q14AI6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpusd3Q14AI6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpusd3Q14AI6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpusd3Q14AI6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpusd3Q14AI6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpusd3Q14AI6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpusd3Q14AI6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpusd3Q14AI6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpusd3Q14AI6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpusd3Q14AI6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpusd3Q14AI6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpusd3Q14AI6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpusd3Q14AI6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpusd3Q14AI6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpusd3Q14AI6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpusd3Q14AI6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpusd3Q14AI6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpusd3Q14AI6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpusd3Q14AI6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpusd3Q14AI6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpusd3Q14AI6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpusd3Q14AI6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpusd3Q14AI6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpusd3Q14AI6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpusd3Q14AI6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpusd3Q14AI6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpusd3Q14AI6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpusd3Q14AI6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpusd3Q14AI6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpusd3Q14AI6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpusd3Q14AI6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpusd3Q14AI6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpusd3Q14AI6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpusd3Q14AI6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpusd3Q14AI6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpusd3Q14AI6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpusd3Q14AI6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpusd3Q14AI6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpusd3Q14AI6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpusd3Q14AI6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms