Protein–RNA interactions for Protein: Q0P523

Cib3, Calcium and integrin-binding family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib3Q0P523 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cib3Q0P523 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cib3Q0P523 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cib3Q0P523 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cib3Q0P523 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cib3Q0P523 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cib3Q0P523 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Cib3Q0P523 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cib3Q0P523 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cib3Q0P523 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cib3Q0P523 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cib3Q0P523 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cib3Q0P523 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Cib3Q0P523 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cib3Q0P523 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cib3Q0P523 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cib3Q0P523 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cib3Q0P523 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cib3Q0P523 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cib3Q0P523 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cib3Q0P523 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cib3Q0P523 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cib3Q0P523 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cib3Q0P523 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cib3Q0P523 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cib3Q0P523 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cib3Q0P523 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cib3Q0P523 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cib3Q0P523 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cib3Q0P523 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cib3Q0P523 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cib3Q0P523 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cib3Q0P523 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cib3Q0P523 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cib3Q0P523 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cib3Q0P523 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cib3Q0P523 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cib3Q0P523 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cib3Q0P523 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cib3Q0P523 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cib3Q0P523 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cib3Q0P523 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cib3Q0P523 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cib3Q0P523 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cib3Q0P523 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cib3Q0P523 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cib3Q0P523 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cib3Q0P523 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cib3Q0P523 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cib3Q0P523 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cib3Q0P523 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cib3Q0P523 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cib3Q0P523 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cib3Q0P523 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cib3Q0P523 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cib3Q0P523 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cib3Q0P523 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cib3Q0P523 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cib3Q0P523 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cib3Q0P523 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cib3Q0P523 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cib3Q0P523 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cib3Q0P523 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cib3Q0P523 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cib3Q0P523 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cib3Q0P523 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cib3Q0P523 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cib3Q0P523 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cib3Q0P523 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cib3Q0P523 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cib3Q0P523 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cib3Q0P523 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cib3Q0P523 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cib3Q0P523 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cib3Q0P523 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cib3Q0P523 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cib3Q0P523 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cib3Q0P523 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cib3Q0P523 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cib3Q0P523 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cib3Q0P523 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cib3Q0P523 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cib3Q0P523 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cib3Q0P523 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cib3Q0P523 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Cib3Q0P523 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cib3Q0P523 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cib3Q0P523 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cib3Q0P523 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cib3Q0P523 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cib3Q0P523 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cib3Q0P523 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cib3Q0P523 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cib3Q0P523 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cib3Q0P523 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cib3Q0P523 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cib3Q0P523 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cib3Q0P523 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cib3Q0P523 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cib3Q0P523 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms