Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tff1Q08423 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tff1Q08423 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tff1Q08423 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tff1Q08423 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tff1Q08423 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tff1Q08423 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tff1Q08423 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tff1Q08423 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tff1Q08423 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tff1Q08423 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tff1Q08423 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tff1Q08423 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tff1Q08423 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tff1Q08423 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tff1Q08423 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tff1Q08423 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tff1Q08423 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tff1Q08423 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tff1Q08423 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tff1Q08423 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tff1Q08423 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tff1Q08423 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tff1Q08423 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tff1Q08423 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tff1Q08423 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tff1Q08423 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tff1Q08423 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tff1Q08423 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tff1Q08423 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tff1Q08423 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tff1Q08423 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tff1Q08423 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tff1Q08423 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tff1Q08423 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Tff1Q08423 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tff1Q08423 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tff1Q08423 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tff1Q08423 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tff1Q08423 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tff1Q08423 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tff1Q08423 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tff1Q08423 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tff1Q08423 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tff1Q08423 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tff1Q08423 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tff1Q08423 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tff1Q08423 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tff1Q08423 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tff1Q08423 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tff1Q08423 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tff1Q08423 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tff1Q08423 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Tff1Q08423 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tff1Q08423 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tff1Q08423 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tff1Q08423 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tff1Q08423 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tff1Q08423 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tff1Q08423 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tff1Q08423 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tff1Q08423 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tff1Q08423 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tff1Q08423 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tff1Q08423 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tff1Q08423 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tff1Q08423 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tff1Q08423 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tff1Q08423 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tff1Q08423 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tff1Q08423 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tff1Q08423 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tff1Q08423 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tff1Q08423 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tff1Q08423 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tff1Q08423 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tff1Q08423 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tff1Q08423 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tff1Q08423 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tff1Q08423 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tff1Q08423 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tff1Q08423 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tff1Q08423 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tff1Q08423 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tff1Q08423 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tff1Q08423 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tff1Q08423 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tff1Q08423 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tff1Q08423 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tff1Q08423 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tff1Q08423 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tff1Q08423 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tff1Q08423 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tff1Q08423 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tff1Q08423 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tff1Q08423 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tff1Q08423 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tff1Q08423 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tff1Q08423 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tff1Q08423 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms