Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Crisp3Q03402 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Crisp3Q03402 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Crisp3Q03402 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Crisp3Q03402 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Crisp3Q03402 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Crisp3Q03402 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Crisp3Q03402 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Crisp3Q03402 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Crisp3Q03402 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Crisp3Q03402 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Crisp3Q03402 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Crisp3Q03402 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Crisp3Q03402 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Crisp3Q03402 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Crisp3Q03402 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Crisp3Q03402 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Crisp3Q03402 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Crisp3Q03402 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Crisp3Q03402 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Crisp3Q03402 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Crisp3Q03402 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Crisp3Q03402 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Crisp3Q03402 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Crisp3Q03402 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Crisp3Q03402 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Crisp3Q03402 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Crisp3Q03402 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Crisp3Q03402 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Crisp3Q03402 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Crisp3Q03402 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Crisp3Q03402 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.33■■□□□ 1
Crisp3Q03402 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Crisp3Q03402 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Crisp3Q03402 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Crisp3Q03402 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Crisp3Q03402 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Crisp3Q03402 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Crisp3Q03402 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Crisp3Q03402 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Crisp3Q03402 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Crisp3Q03402 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Crisp3Q03402 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Crisp3Q03402 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Crisp3Q03402 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Crisp3Q03402 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Crisp3Q03402 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Crisp3Q03402 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Crisp3Q03402 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Crisp3Q03402 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Crisp3Q03402 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Crisp3Q03402 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Crisp3Q03402 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Crisp3Q03402 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Crisp3Q03402 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Crisp3Q03402 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Crisp3Q03402 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Crisp3Q03402 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Crisp3Q03402 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Crisp3Q03402 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Crisp3Q03402 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Crisp3Q03402 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Crisp3Q03402 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Crisp3Q03402 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Crisp3Q03402 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Crisp3Q03402 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Crisp3Q03402 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Crisp3Q03402 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Crisp3Q03402 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Crisp3Q03402 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Crisp3Q03402 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Crisp3Q03402 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Crisp3Q03402 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Crisp3Q03402 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Crisp3Q03402 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Crisp3Q03402 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Crisp3Q03402 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Crisp3Q03402 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Crisp3Q03402 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Crisp3Q03402 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Crisp3Q03402 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Crisp3Q03402 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Crisp3Q03402 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Crisp3Q03402 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Crisp3Q03402 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Crisp3Q03402 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Crisp3Q03402 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Crisp3Q03402 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Crisp3Q03402 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Crisp3Q03402 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Crisp3Q03402 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Crisp3Q03402 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Crisp3Q03402 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Crisp3Q03402 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Crisp3Q03402 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Crisp3Q03402 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Crisp3Q03402 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Crisp3Q03402 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Crisp3Q03402 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Crisp3Q03402 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms