Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VldlrP98156 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VldlrP98156 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VldlrP98156 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VldlrP98156 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VldlrP98156 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
VldlrP98156 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VldlrP98156 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VldlrP98156 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VldlrP98156 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VldlrP98156 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VldlrP98156 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VldlrP98156 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VldlrP98156 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VldlrP98156 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VldlrP98156 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VldlrP98156 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VldlrP98156 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VldlrP98156 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
VldlrP98156 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
VldlrP98156 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VldlrP98156 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VldlrP98156 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VldlrP98156 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VldlrP98156 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VldlrP98156 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VldlrP98156 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VldlrP98156 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VldlrP98156 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VldlrP98156 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VldlrP98156 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VldlrP98156 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VldlrP98156 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VldlrP98156 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VldlrP98156 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VldlrP98156 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VldlrP98156 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VldlrP98156 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VldlrP98156 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VldlrP98156 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
VldlrP98156 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VldlrP98156 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VldlrP98156 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VldlrP98156 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VldlrP98156 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VldlrP98156 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VldlrP98156 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VldlrP98156 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VldlrP98156 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
VldlrP98156 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VldlrP98156 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VldlrP98156 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VldlrP98156 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VldlrP98156 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VldlrP98156 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VldlrP98156 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VldlrP98156 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VldlrP98156 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VldlrP98156 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VldlrP98156 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VldlrP98156 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VldlrP98156 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VldlrP98156 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VldlrP98156 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VldlrP98156 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VldlrP98156 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
VldlrP98156 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VldlrP98156 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
VldlrP98156 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VldlrP98156 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VldlrP98156 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VldlrP98156 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VldlrP98156 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VldlrP98156 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
VldlrP98156 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VldlrP98156 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VldlrP98156 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VldlrP98156 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VldlrP98156 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VldlrP98156 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VldlrP98156 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
VldlrP98156 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VldlrP98156 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
VldlrP98156 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VldlrP98156 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VldlrP98156 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VldlrP98156 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
VldlrP98156 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VldlrP98156 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VldlrP98156 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
VldlrP98156 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VldlrP98156 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VldlrP98156 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VldlrP98156 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VldlrP98156 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VldlrP98156 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VldlrP98156 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VldlrP98156 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VldlrP98156 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VldlrP98156 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms