Protein–RNA interactions for Protein: P70704

Atp8a1, Phospholipid-transporting ATPase IA, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8a1P70704 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Atp8a1P70704 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Atp8a1P70704 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Atp8a1P70704 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Atp8a1P70704 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atp8a1P70704 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atp8a1P70704 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atp8a1P70704 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Atp8a1P70704 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Atp8a1P70704 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Atp8a1P70704 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Atp8a1P70704 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Atp8a1P70704 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atp8a1P70704 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Atp8a1P70704 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Atp8a1P70704 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Atp8a1P70704 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atp8a1P70704 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Atp8a1P70704 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atp8a1P70704 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atp8a1P70704 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atp8a1P70704 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atp8a1P70704 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atp8a1P70704 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atp8a1P70704 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Atp8a1P70704 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Atp8a1P70704 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atp8a1P70704 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Atp8a1P70704 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Atp8a1P70704 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atp8a1P70704 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atp8a1P70704 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atp8a1P70704 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atp8a1P70704 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atp8a1P70704 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atp8a1P70704 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Atp8a1P70704 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Atp8a1P70704 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atp8a1P70704 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Atp8a1P70704 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atp8a1P70704 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atp8a1P70704 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atp8a1P70704 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atp8a1P70704 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atp8a1P70704 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atp8a1P70704 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atp8a1P70704 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp8a1P70704 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Atp8a1P70704 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atp8a1P70704 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atp8a1P70704 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atp8a1P70704 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Atp8a1P70704 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Atp8a1P70704 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atp8a1P70704 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atp8a1P70704 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Atp8a1P70704 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atp8a1P70704 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atp8a1P70704 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atp8a1P70704 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atp8a1P70704 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atp8a1P70704 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atp8a1P70704 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atp8a1P70704 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atp8a1P70704 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atp8a1P70704 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atp8a1P70704 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atp8a1P70704 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Atp8a1P70704 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atp8a1P70704 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Atp8a1P70704 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atp8a1P70704 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp8a1P70704 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp8a1P70704 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp8a1P70704 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atp8a1P70704 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atp8a1P70704 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atp8a1P70704 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Atp8a1P70704 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Atp8a1P70704 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atp8a1P70704 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atp8a1P70704 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Atp8a1P70704 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atp8a1P70704 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atp8a1P70704 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atp8a1P70704 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atp8a1P70704 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atp8a1P70704 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Atp8a1P70704 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atp8a1P70704 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atp8a1P70704 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atp8a1P70704 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Atp8a1P70704 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Atp8a1P70704 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atp8a1P70704 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atp8a1P70704 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atp8a1P70704 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atp8a1P70704 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Atp8a1P70704 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Atp8a1P70704 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms