Protein–RNA interactions for Protein: P70459

Erf, ETS domain-containing transcription factor ERF, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErfP70459 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ErfP70459 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ErfP70459 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ErfP70459 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ErfP70459 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ErfP70459 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ErfP70459 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ErfP70459 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ErfP70459 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ErfP70459 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ErfP70459 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ErfP70459 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ErfP70459 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ErfP70459 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ErfP70459 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ErfP70459 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ErfP70459 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ErfP70459 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ErfP70459 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ErfP70459 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ErfP70459 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ErfP70459 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ErfP70459 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ErfP70459 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ErfP70459 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ErfP70459 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ErfP70459 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ErfP70459 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ErfP70459 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ErfP70459 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ErfP70459 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ErfP70459 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ErfP70459 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ErfP70459 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ErfP70459 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ErfP70459 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ErfP70459 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ErfP70459 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ErfP70459 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ErfP70459 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ErfP70459 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ErfP70459 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ErfP70459 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ErfP70459 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ErfP70459 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ErfP70459 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ErfP70459 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ErfP70459 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ErfP70459 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ErfP70459 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ErfP70459 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ErfP70459 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ErfP70459 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ErfP70459 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ErfP70459 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ErfP70459 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ErfP70459 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ErfP70459 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ErfP70459 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ErfP70459 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ErfP70459 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ErfP70459 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ErfP70459 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ErfP70459 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ErfP70459 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ErfP70459 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ErfP70459 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ErfP70459 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ErfP70459 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ErfP70459 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ErfP70459 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ErfP70459 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ErfP70459 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ErfP70459 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ErfP70459 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ErfP70459 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ErfP70459 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ErfP70459 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ErfP70459 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ErfP70459 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ErfP70459 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ErfP70459 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ErfP70459 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ErfP70459 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ErfP70459 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ErfP70459 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ErfP70459 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ErfP70459 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ErfP70459 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ErfP70459 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ErfP70459 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ErfP70459 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ErfP70459 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ErfP70459 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ErfP70459 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ErfP70459 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ErfP70459 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ErfP70459 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ErfP70459 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ErfP70459 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms