Protein–RNA interactions for Protein: P70414

Slc8a1, Sodium/calcium exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8a1P70414 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Slc8a1P70414 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Slc8a1P70414 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slc8a1P70414 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Slc8a1P70414 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Slc8a1P70414 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slc8a1P70414 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slc8a1P70414 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slc8a1P70414 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Slc8a1P70414 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Slc8a1P70414 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Slc8a1P70414 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Slc8a1P70414 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Slc8a1P70414 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Slc8a1P70414 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Slc8a1P70414 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Slc8a1P70414 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Slc8a1P70414 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slc8a1P70414 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Slc8a1P70414 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Slc8a1P70414 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Slc8a1P70414 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slc8a1P70414 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Slc8a1P70414 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Slc8a1P70414 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Slc8a1P70414 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Slc8a1P70414 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Slc8a1P70414 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Slc8a1P70414 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Slc8a1P70414 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Slc8a1P70414 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Slc8a1P70414 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Slc8a1P70414 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Slc8a1P70414 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slc8a1P70414 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slc8a1P70414 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slc8a1P70414 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Slc8a1P70414 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slc8a1P70414 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slc8a1P70414 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Slc8a1P70414 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Slc8a1P70414 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Slc8a1P70414 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Slc8a1P70414 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Slc8a1P70414 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slc8a1P70414 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slc8a1P70414 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slc8a1P70414 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Slc8a1P70414 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slc8a1P70414 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Slc8a1P70414 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slc8a1P70414 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slc8a1P70414 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slc8a1P70414 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slc8a1P70414 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slc8a1P70414 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slc8a1P70414 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slc8a1P70414 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slc8a1P70414 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slc8a1P70414 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Slc8a1P70414 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slc8a1P70414 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slc8a1P70414 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slc8a1P70414 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slc8a1P70414 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slc8a1P70414 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slc8a1P70414 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slc8a1P70414 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slc8a1P70414 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Slc8a1P70414 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slc8a1P70414 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slc8a1P70414 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Slc8a1P70414 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slc8a1P70414 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Slc8a1P70414 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Slc8a1P70414 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Slc8a1P70414 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Slc8a1P70414 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Slc8a1P70414 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Slc8a1P70414 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Slc8a1P70414 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Slc8a1P70414 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Slc8a1P70414 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Slc8a1P70414 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Slc8a1P70414 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Slc8a1P70414 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Slc8a1P70414 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Slc8a1P70414 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Slc8a1P70414 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Slc8a1P70414 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Slc8a1P70414 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Slc8a1P70414 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Slc8a1P70414 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Slc8a1P70414 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Slc8a1P70414 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Slc8a1P70414 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slc8a1P70414 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slc8a1P70414 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Slc8a1P70414 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slc8a1P70414 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms