Protein–RNA interactions for Protein: P70414

Slc8a1, Sodium/calcium exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8a1P70414 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Slc8a1P70414 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,7■■■□□ 2,02
Slc8a1P70414 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Slc8a1P70414 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27,64■■■□□ 2,02
Slc8a1P70414 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,01
Slc8a1P70414 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Slc8a1P70414 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,59■■■□□ 2,01
Slc8a1P70414 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27,58■■■□□ 2,01
Slc8a1P70414 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Slc8a1P70414 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,53■■■□□ 2
Slc8a1P70414 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27,53■■■□□ 2
Slc8a1P70414 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Slc8a1P70414 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Slc8a1P70414 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Slc8a1P70414 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Slc8a1P70414 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Slc8a1P70414 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Slc8a1P70414 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27,36■■□□□ 1,97
Slc8a1P70414 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Slc8a1P70414 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27,32■■□□□ 1,96
Slc8a1P70414 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Slc8a1P70414 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Slc8a1P70414 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Slc8a1P70414 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27,22■■□□□ 1,95
Slc8a1P70414 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27,22■■□□□ 1,95
Slc8a1P70414 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Slc8a1P70414 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Slc8a1P70414 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27,19■■□□□ 1,94
Slc8a1P70414 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Slc8a1P70414 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27,17■■□□□ 1,94
Slc8a1P70414 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,16■■□□□ 1,94
Slc8a1P70414 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Slc8a1P70414 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27,14■■□□□ 1,94
Slc8a1P70414 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Slc8a1P70414 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Slc8a1P70414 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Slc8a1P70414 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Slc8a1P70414 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Slc8a1P70414 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Slc8a1P70414 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27,04■■□□□ 1,92
Slc8a1P70414 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Slc8a1P70414 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Slc8a1P70414 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27,03■■□□□ 1,92
Slc8a1P70414 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Slc8a1P70414 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Slc8a1P70414 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Slc8a1P70414 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Slc8a1P70414 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26,97■■□□□ 1,91
Slc8a1P70414 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,96■■□□□ 1,91
Slc8a1P70414 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Slc8a1P70414 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Slc8a1P70414 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Slc8a1P70414 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Slc8a1P70414 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Slc8a1P70414 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26,87■■□□□ 1,89
Slc8a1P70414 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Slc8a1P70414 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26,87■■□□□ 1,89
Slc8a1P70414 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Slc8a1P70414 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Slc8a1P70414 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26,81■■□□□ 1,88
Slc8a1P70414 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26,81■■□□□ 1,88
Slc8a1P70414 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Slc8a1P70414 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Slc8a1P70414 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Slc8a1P70414 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Slc8a1P70414 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26,76■■□□□ 1,87
Slc8a1P70414 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Slc8a1P70414 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26,72■■□□□ 1,87
Slc8a1P70414 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,87
Slc8a1P70414 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Slc8a1P70414 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26,61■■□□□ 1,85
Slc8a1P70414 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Slc8a1P70414 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Slc8a1P70414 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26,53■■□□□ 1,84
Slc8a1P70414 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Slc8a1P70414 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Slc8a1P70414 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Slc8a1P70414 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Slc8a1P70414 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26,48■■□□□ 1,83
Slc8a1P70414 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Slc8a1P70414 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Slc8a1P70414 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,82
Slc8a1P70414 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,82
Slc8a1P70414 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,82
Slc8a1P70414 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,45■■□□□ 1,82
Slc8a1P70414 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Slc8a1P70414 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Slc8a1P70414 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Slc8a1P70414 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Slc8a1P70414 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
Slc8a1P70414 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Slc8a1P70414 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Slc8a1P70414 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Slc8a1P70414 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Slc8a1P70414 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26,34■■□□□ 1,81
Slc8a1P70414 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Slc8a1P70414 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26,29■■□□□ 1,8
Slc8a1P70414 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26,29■■□□□ 1,8
Slc8a1P70414 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Slc8a1P70414 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,1 ms