Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Traf6P70196 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Traf6P70196 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Traf6P70196 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Traf6P70196 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Traf6P70196 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Traf6P70196 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Traf6P70196 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Traf6P70196 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Traf6P70196 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Traf6P70196 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Traf6P70196 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Traf6P70196 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Traf6P70196 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Traf6P70196 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Traf6P70196 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Traf6P70196 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Traf6P70196 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Traf6P70196 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Traf6P70196 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Traf6P70196 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Traf6P70196 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Traf6P70196 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Traf6P70196 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Traf6P70196 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Traf6P70196 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Traf6P70196 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Traf6P70196 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Traf6P70196 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Traf6P70196 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Traf6P70196 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Traf6P70196 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Traf6P70196 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Traf6P70196 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Traf6P70196 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Traf6P70196 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Traf6P70196 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Traf6P70196 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Traf6P70196 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Traf6P70196 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Traf6P70196 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Traf6P70196 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Traf6P70196 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Traf6P70196 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Traf6P70196 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Traf6P70196 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Traf6P70196 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Traf6P70196 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Traf6P70196 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Traf6P70196 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Traf6P70196 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Traf6P70196 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Traf6P70196 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Traf6P70196 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Traf6P70196 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Traf6P70196 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Traf6P70196 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Traf6P70196 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Traf6P70196 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Traf6P70196 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Traf6P70196 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Traf6P70196 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Traf6P70196 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Traf6P70196 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Traf6P70196 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Traf6P70196 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Traf6P70196 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Traf6P70196 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Traf6P70196 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Traf6P70196 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Traf6P70196 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Traf6P70196 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Traf6P70196 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Traf6P70196 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Traf6P70196 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Traf6P70196 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Traf6P70196 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Traf6P70196 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Traf6P70196 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Traf6P70196 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Traf6P70196 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Traf6P70196 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Traf6P70196 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Traf6P70196 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Traf6P70196 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Traf6P70196 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Traf6P70196 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Traf6P70196 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Traf6P70196 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Traf6P70196 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Traf6P70196 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Traf6P70196 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Traf6P70196 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Traf6P70196 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Traf6P70196 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Traf6P70196 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Traf6P70196 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Traf6P70196 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Traf6P70196 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Traf6P70196 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms