Protein–RNA interactions for Protein: P63058

Thra, Thyroid hormone receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThraP63058 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ThraP63058 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ThraP63058 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ThraP63058 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ThraP63058 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ThraP63058 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ThraP63058 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ThraP63058 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ThraP63058 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ThraP63058 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ThraP63058 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ThraP63058 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ThraP63058 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ThraP63058 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ThraP63058 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ThraP63058 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ThraP63058 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ThraP63058 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ThraP63058 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ThraP63058 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ThraP63058 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ThraP63058 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ThraP63058 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ThraP63058 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ThraP63058 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ThraP63058 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ThraP63058 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ThraP63058 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ThraP63058 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ThraP63058 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ThraP63058 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ThraP63058 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ThraP63058 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ThraP63058 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ThraP63058 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ThraP63058 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ThraP63058 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ThraP63058 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ThraP63058 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ThraP63058 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ThraP63058 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ThraP63058 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ThraP63058 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ThraP63058 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ThraP63058 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ThraP63058 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ThraP63058 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ThraP63058 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ThraP63058 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ThraP63058 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ThraP63058 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ThraP63058 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ThraP63058 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ThraP63058 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ThraP63058 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ThraP63058 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ThraP63058 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ThraP63058 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ThraP63058 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ThraP63058 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ThraP63058 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ThraP63058 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ThraP63058 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ThraP63058 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ThraP63058 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ThraP63058 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ThraP63058 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ThraP63058 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ThraP63058 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ThraP63058 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ThraP63058 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ThraP63058 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ThraP63058 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ThraP63058 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ThraP63058 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ThraP63058 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ThraP63058 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ThraP63058 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ThraP63058 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ThraP63058 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ThraP63058 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ThraP63058 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ThraP63058 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ThraP63058 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ThraP63058 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ThraP63058 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ThraP63058 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ThraP63058 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ThraP63058 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ThraP63058 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ThraP63058 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ThraP63058 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ThraP63058 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ThraP63058 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ThraP63058 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ThraP63058 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ThraP63058 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ThraP63058 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ThraP63058 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ThraP63058 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms