Protein–RNA interactions for Protein: P62889

Rpl30, 60S ribosomal protein L30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl30P62889 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpl30P62889 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpl30P62889 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpl30P62889 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpl30P62889 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpl30P62889 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpl30P62889 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpl30P62889 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpl30P62889 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpl30P62889 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpl30P62889 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpl30P62889 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpl30P62889 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpl30P62889 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpl30P62889 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpl30P62889 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpl30P62889 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpl30P62889 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpl30P62889 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpl30P62889 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpl30P62889 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpl30P62889 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpl30P62889 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpl30P62889 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpl30P62889 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpl30P62889 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpl30P62889 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpl30P62889 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl30P62889 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl30P62889 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpl30P62889 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpl30P62889 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl30P62889 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpl30P62889 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpl30P62889 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpl30P62889 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Rpl30P62889 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rpl30P62889 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpl30P62889 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpl30P62889 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpl30P62889 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpl30P62889 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpl30P62889 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpl30P62889 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpl30P62889 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpl30P62889 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpl30P62889 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpl30P62889 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpl30P62889 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpl30P62889 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpl30P62889 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpl30P62889 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpl30P62889 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpl30P62889 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpl30P62889 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpl30P62889 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpl30P62889 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpl30P62889 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpl30P62889 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpl30P62889 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpl30P62889 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpl30P62889 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpl30P62889 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpl30P62889 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpl30P62889 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpl30P62889 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpl30P62889 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpl30P62889 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpl30P62889 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpl30P62889 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpl30P62889 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpl30P62889 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpl30P62889 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpl30P62889 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpl30P62889 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpl30P62889 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpl30P62889 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpl30P62889 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpl30P62889 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpl30P62889 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpl30P62889 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpl30P62889 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpl30P62889 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpl30P62889 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpl30P62889 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpl30P62889 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl30P62889 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl30P62889 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl30P62889 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl30P62889 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl30P62889 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl30P62889 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl30P62889 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl30P62889 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl30P62889 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl30P62889 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl30P62889 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpl30P62889 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpl30P62889 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rpl30P62889 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms