Protein–RNA interactions for Protein: P62743

Ap2s1, AP-2 complex subunit sigma, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap2s1P62743 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ap2s1P62743 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ap2s1P62743 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ap2s1P62743 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ap2s1P62743 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ap2s1P62743 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ap2s1P62743 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ap2s1P62743 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ap2s1P62743 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ap2s1P62743 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ap2s1P62743 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ap2s1P62743 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ap2s1P62743 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ap2s1P62743 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ap2s1P62743 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ap2s1P62743 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ap2s1P62743 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ap2s1P62743 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ap2s1P62743 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ap2s1P62743 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ap2s1P62743 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ap2s1P62743 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ap2s1P62743 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ap2s1P62743 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ap2s1P62743 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ap2s1P62743 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ap2s1P62743 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ap2s1P62743 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ap2s1P62743 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ap2s1P62743 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ap2s1P62743 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ap2s1P62743 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ap2s1P62743 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ap2s1P62743 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ap2s1P62743 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ap2s1P62743 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ap2s1P62743 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ap2s1P62743 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap2s1P62743 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap2s1P62743 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ap2s1P62743 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ap2s1P62743 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ap2s1P62743 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap2s1P62743 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap2s1P62743 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap2s1P62743 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ap2s1P62743 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ap2s1P62743 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ap2s1P62743 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ap2s1P62743 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ap2s1P62743 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ap2s1P62743 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ap2s1P62743 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ap2s1P62743 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ap2s1P62743 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ap2s1P62743 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ap2s1P62743 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ap2s1P62743 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ap2s1P62743 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ap2s1P62743 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ap2s1P62743 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ap2s1P62743 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ap2s1P62743 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ap2s1P62743 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ap2s1P62743 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ap2s1P62743 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ap2s1P62743 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ap2s1P62743 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ap2s1P62743 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ap2s1P62743 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ap2s1P62743 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ap2s1P62743 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ap2s1P62743 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ap2s1P62743 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ap2s1P62743 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ap2s1P62743 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ap2s1P62743 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ap2s1P62743 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ap2s1P62743 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ap2s1P62743 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ap2s1P62743 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ap2s1P62743 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ap2s1P62743 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ap2s1P62743 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ap2s1P62743 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ap2s1P62743 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ap2s1P62743 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ap2s1P62743 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ap2s1P62743 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ap2s1P62743 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap2s1P62743 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap2s1P62743 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap2s1P62743 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ap2s1P62743 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ap2s1P62743 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ap2s1P62743 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ap2s1P62743 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ap2s1P62743 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ap2s1P62743 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ap2s1P62743 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.9 ms