Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ube2kP61087 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ube2kP61087 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ube2kP61087 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ube2kP61087 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ube2kP61087 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube2kP61087 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube2kP61087 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube2kP61087 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube2kP61087 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube2kP61087 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube2kP61087 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube2kP61087 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube2kP61087 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube2kP61087 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ube2kP61087 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ube2kP61087 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube2kP61087 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube2kP61087 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ube2kP61087 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube2kP61087 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ube2kP61087 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ube2kP61087 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ube2kP61087 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ube2kP61087 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube2kP61087 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube2kP61087 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube2kP61087 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ube2kP61087 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube2kP61087 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube2kP61087 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube2kP61087 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ube2kP61087 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube2kP61087 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube2kP61087 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2kP61087 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube2kP61087 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube2kP61087 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube2kP61087 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube2kP61087 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube2kP61087 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube2kP61087 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ube2kP61087 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ube2kP61087 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube2kP61087 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ube2kP61087 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube2kP61087 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube2kP61087 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube2kP61087 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube2kP61087 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube2kP61087 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube2kP61087 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube2kP61087 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube2kP61087 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ube2kP61087 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ube2kP61087 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ube2kP61087 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ube2kP61087 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ube2kP61087 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ube2kP61087 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ube2kP61087 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ube2kP61087 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ube2kP61087 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ube2kP61087 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ube2kP61087 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ube2kP61087 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ube2kP61087 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ube2kP61087 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ube2kP61087 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ube2kP61087 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube2kP61087 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube2kP61087 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube2kP61087 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube2kP61087 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube2kP61087 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ube2kP61087 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ube2kP61087 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ube2kP61087 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ube2kP61087 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ube2kP61087 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ube2kP61087 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ube2kP61087 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ube2kP61087 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ube2kP61087 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ube2kP61087 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ube2kP61087 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ube2kP61087 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ube2kP61087 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ube2kP61087 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ube2kP61087 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ube2kP61087 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ube2kP61087 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ube2kP61087 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ube2kP61087 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ube2kP61087 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ube2kP61087 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ube2kP61087 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ube2kP61087 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ube2kP61087 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ube2kP61087 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms