Protein–RNA interactions for Protein: P56475

Gabrr1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrr1P56475 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gabrr1P56475 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gabrr1P56475 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gabrr1P56475 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gabrr1P56475 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gabrr1P56475 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gabrr1P56475 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gabrr1P56475 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gabrr1P56475 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gabrr1P56475 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gabrr1P56475 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gabrr1P56475 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gabrr1P56475 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gabrr1P56475 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gabrr1P56475 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gabrr1P56475 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gabrr1P56475 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gabrr1P56475 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gabrr1P56475 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gabrr1P56475 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gabrr1P56475 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gabrr1P56475 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gabrr1P56475 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gabrr1P56475 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gabrr1P56475 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gabrr1P56475 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gabrr1P56475 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gabrr1P56475 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gabrr1P56475 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gabrr1P56475 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gabrr1P56475 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gabrr1P56475 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabrr1P56475 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabrr1P56475 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabrr1P56475 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabrr1P56475 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gabrr1P56475 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gabrr1P56475 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gabrr1P56475 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gabrr1P56475 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gabrr1P56475 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gabrr1P56475 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gabrr1P56475 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gabrr1P56475 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gabrr1P56475 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gabrr1P56475 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gabrr1P56475 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gabrr1P56475 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gabrr1P56475 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gabrr1P56475 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gabrr1P56475 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gabrr1P56475 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gabrr1P56475 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gabrr1P56475 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gabrr1P56475 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gabrr1P56475 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gabrr1P56475 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gabrr1P56475 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gabrr1P56475 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gabrr1P56475 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gabrr1P56475 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gabrr1P56475 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gabrr1P56475 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gabrr1P56475 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gabrr1P56475 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gabrr1P56475 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gabrr1P56475 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gabrr1P56475 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gabrr1P56475 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gabrr1P56475 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gabrr1P56475 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gabrr1P56475 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gabrr1P56475 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gabrr1P56475 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gabrr1P56475 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gabrr1P56475 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gabrr1P56475 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gabrr1P56475 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gabrr1P56475 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gabrr1P56475 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gabrr1P56475 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gabrr1P56475 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gabrr1P56475 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gabrr1P56475 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gabrr1P56475 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gabrr1P56475 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gabrr1P56475 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gabrr1P56475 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gabrr1P56475 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gabrr1P56475 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gabrr1P56475 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gabrr1P56475 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gabrr1P56475 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gabrr1P56475 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gabrr1P56475 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gabrr1P56475 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gabrr1P56475 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gabrr1P56475 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gabrr1P56475 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gabrr1P56475 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms