Protein–RNA interactions for Protein: P51125

Cast, Calpastatin, mousemouse

Predictions only

Length 788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CastP51125 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CastP51125 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CastP51125 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CastP51125 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
CastP51125 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CastP51125 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CastP51125 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CastP51125 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CastP51125 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CastP51125 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CastP51125 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CastP51125 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CastP51125 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CastP51125 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CastP51125 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CastP51125 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CastP51125 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CastP51125 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CastP51125 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CastP51125 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CastP51125 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CastP51125 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CastP51125 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CastP51125 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
CastP51125 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CastP51125 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CastP51125 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CastP51125 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
CastP51125 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CastP51125 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CastP51125 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CastP51125 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CastP51125 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CastP51125 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CastP51125 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CastP51125 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CastP51125 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CastP51125 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
CastP51125 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CastP51125 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CastP51125 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CastP51125 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CastP51125 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CastP51125 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CastP51125 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CastP51125 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CastP51125 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CastP51125 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
CastP51125 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
CastP51125 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CastP51125 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CastP51125 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CastP51125 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CastP51125 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC35■■■■□ 3.19
CastP51125 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CastP51125 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CastP51125 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CastP51125 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CastP51125 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CastP51125 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CastP51125 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CastP51125 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CastP51125 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CastP51125 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CastP51125 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CastP51125 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CastP51125 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CastP51125 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CastP51125 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CastP51125 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CastP51125 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CastP51125 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
CastP51125 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
CastP51125 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CastP51125 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CastP51125 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CastP51125 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CastP51125 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CastP51125 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CastP51125 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CastP51125 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CastP51125 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CastP51125 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CastP51125 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CastP51125 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CastP51125 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CastP51125 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CastP51125 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CastP51125 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CastP51125 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CastP51125 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CastP51125 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CastP51125 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CastP51125 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CastP51125 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CastP51125 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CastP51125 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CastP51125 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CastP51125 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
CastP51125 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms