Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Defa6P50704 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Defa6P50704 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Defa6P50704 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Defa6P50704 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Defa6P50704 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Defa6P50704 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Defa6P50704 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Defa6P50704 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Defa6P50704 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Defa6P50704 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Defa6P50704 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Defa6P50704 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Defa6P50704 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Defa6P50704 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Defa6P50704 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Defa6P50704 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Defa6P50704 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Defa6P50704 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Defa6P50704 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Defa6P50704 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Defa6P50704 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Defa6P50704 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Defa6P50704 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Defa6P50704 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Defa6P50704 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Defa6P50704 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Defa6P50704 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Defa6P50704 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Defa6P50704 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Defa6P50704 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Defa6P50704 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Defa6P50704 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Defa6P50704 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Defa6P50704 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Defa6P50704 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Defa6P50704 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Defa6P50704 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Defa6P50704 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Defa6P50704 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Defa6P50704 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Defa6P50704 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Defa6P50704 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Defa6P50704 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Defa6P50704 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Defa6P50704 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Defa6P50704 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Defa6P50704 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Defa6P50704 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Defa6P50704 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Defa6P50704 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Defa6P50704 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Defa6P50704 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Defa6P50704 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Defa6P50704 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Defa6P50704 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Defa6P50704 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Defa6P50704 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Defa6P50704 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Defa6P50704 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Defa6P50704 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Defa6P50704 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Defa6P50704 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Defa6P50704 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Defa6P50704 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Defa6P50704 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Defa6P50704 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Defa6P50704 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Defa6P50704 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Defa6P50704 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Defa6P50704 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Defa6P50704 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Defa6P50704 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Defa6P50704 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Defa6P50704 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Defa6P50704 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Defa6P50704 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Defa6P50704 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Defa6P50704 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Defa6P50704 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Defa6P50704 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Defa6P50704 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Defa6P50704 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Defa6P50704 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Defa6P50704 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Defa6P50704 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Defa6P50704 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Defa6P50704 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Defa6P50704 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Defa6P50704 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Defa6P50704 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Defa6P50704 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Defa6P50704 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Defa6P50704 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Defa6P50704 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Defa6P50704 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Defa6P50704 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Defa6P50704 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Defa6P50704 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Defa6P50704 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms