Protein–RNA interactions for Protein: P50428

Arsa, Arylsulfatase A, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArsaP50428 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ArsaP50428 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ArsaP50428 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ArsaP50428 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ArsaP50428 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ArsaP50428 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ArsaP50428 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ArsaP50428 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ArsaP50428 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ArsaP50428 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ArsaP50428 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ArsaP50428 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ArsaP50428 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ArsaP50428 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ArsaP50428 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ArsaP50428 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ArsaP50428 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ArsaP50428 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ArsaP50428 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ArsaP50428 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ArsaP50428 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ArsaP50428 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ArsaP50428 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ArsaP50428 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ArsaP50428 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ArsaP50428 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ArsaP50428 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ArsaP50428 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ArsaP50428 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ArsaP50428 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ArsaP50428 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ArsaP50428 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ArsaP50428 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ArsaP50428 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ArsaP50428 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ArsaP50428 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ArsaP50428 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ArsaP50428 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ArsaP50428 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ArsaP50428 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ArsaP50428 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ArsaP50428 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ArsaP50428 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ArsaP50428 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ArsaP50428 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ArsaP50428 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ArsaP50428 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ArsaP50428 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ArsaP50428 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ArsaP50428 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ArsaP50428 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ArsaP50428 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ArsaP50428 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ArsaP50428 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ArsaP50428 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ArsaP50428 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ArsaP50428 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ArsaP50428 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ArsaP50428 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ArsaP50428 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ArsaP50428 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ArsaP50428 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ArsaP50428 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ArsaP50428 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ArsaP50428 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ArsaP50428 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ArsaP50428 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ArsaP50428 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ArsaP50428 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ArsaP50428 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ArsaP50428 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ArsaP50428 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ArsaP50428 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ArsaP50428 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ArsaP50428 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ArsaP50428 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ArsaP50428 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ArsaP50428 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ArsaP50428 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
ArsaP50428 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ArsaP50428 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ArsaP50428 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ArsaP50428 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ArsaP50428 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ArsaP50428 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ArsaP50428 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ArsaP50428 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ArsaP50428 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ArsaP50428 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ArsaP50428 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ArsaP50428 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ArsaP50428 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ArsaP50428 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ArsaP50428 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ArsaP50428 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ArsaP50428 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ArsaP50428 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ArsaP50428 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ArsaP50428 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ArsaP50428 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.6 ms