Protein–RNA interactions for Protein: P49962

Srp9, Signal recognition particle 9 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp9P49962 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Srp9P49962 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Srp9P49962 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srp9P49962 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srp9P49962 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Srp9P49962 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srp9P49962 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srp9P49962 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Srp9P49962 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srp9P49962 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srp9P49962 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srp9P49962 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srp9P49962 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srp9P49962 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srp9P49962 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srp9P49962 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srp9P49962 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srp9P49962 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srp9P49962 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srp9P49962 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srp9P49962 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srp9P49962 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srp9P49962 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srp9P49962 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Srp9P49962 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srp9P49962 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srp9P49962 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srp9P49962 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srp9P49962 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Srp9P49962 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Srp9P49962 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Srp9P49962 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srp9P49962 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srp9P49962 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srp9P49962 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srp9P49962 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srp9P49962 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srp9P49962 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srp9P49962 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Srp9P49962 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srp9P49962 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srp9P49962 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srp9P49962 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srp9P49962 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srp9P49962 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srp9P49962 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Srp9P49962 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srp9P49962 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srp9P49962 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srp9P49962 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srp9P49962 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Srp9P49962 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Srp9P49962 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Srp9P49962 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Srp9P49962 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Srp9P49962 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Srp9P49962 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Srp9P49962 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Srp9P49962 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srp9P49962 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srp9P49962 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srp9P49962 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srp9P49962 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Srp9P49962 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srp9P49962 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Srp9P49962 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Srp9P49962 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srp9P49962 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srp9P49962 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srp9P49962 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srp9P49962 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srp9P49962 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srp9P49962 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srp9P49962 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Srp9P49962 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Srp9P49962 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Srp9P49962 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Srp9P49962 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Srp9P49962 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Srp9P49962 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Srp9P49962 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Srp9P49962 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Srp9P49962 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Srp9P49962 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Srp9P49962 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Srp9P49962 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Srp9P49962 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Srp9P49962 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Srp9P49962 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Srp9P49962 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Srp9P49962 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srp9P49962 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Srp9P49962 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Srp9P49962 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srp9P49962 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srp9P49962 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Srp9P49962 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Srp9P49962 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Srp9P49962 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Srp9P49962 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms